我在sparkDataframe中有非常大的数据集,分布在节点上。我可以做一些简单的统计,比如 mean
, stdev
, skewness
, kurtosis
使用spark库 pyspark.sql.functions
.
如果我想使用高级统计测试,如jarquebera(jb)或shapirowilk(sw)等,我会使用python库,如 scipy
因为标准的apache pyspark库没有它们。但为了做到这一点,我必须将sparkDataframe转换为pandas,这意味着强制数据进入主节点,如下所示:
import scipy.stats as stats
pandas_df=spark_df.toPandas()
JBtest=stats.jarque_bera(pandas_df)
SWtest=stats.shapiro(pandas_df)
我有多个特性,每个特性id对应于我要在其上执行测试统计的数据集。
我的问题是:
当数据仍然分布在节点上时,有没有方法在sparkDataframe上应用这些pythonic函数,或者我需要在spark中创建自己的jb/sw测试统计函数?
谢谢你的宝贵见解
1条答案
按热度按时间lsmd5eda1#
您应该能够定义一个矢量化的用户定义函数来 Package pandas函数(https://databricks.com/blog/2017/10/30/introducing-vectorized-udfs-for-pyspark.html),如下所示:
请注意,向量化函数列将列作为其参数并返回列。
(注。这个
@pandas_udf
decorator是将其下面定义的函数转换为向量化函数的工具。返回向量的每个元素本身就是一个标量,这就是为什么参数PandasUDFType.SCALAR
已通过。)