我正在玩和学习hadoopmapreduce。
我正在尝试Mapvcf文件（http://en.wikipedia.org/wiki/variant_call_format )：vcf是一个以制表符分隔的文件，以一个（可能较大的）头开始。此头是获取主体中记录的语义所必需的。

我想创建一个使用这些数据的Map器。为了解码这些行，必须可以从此Map器访问标头。
从http://jayunit100.blogspot.fr/2013/07/hadoop-processing-headers-in-mappers.html ，我使用自定义读取器创建了此inputformat：

public static class VcfInputFormat extends FileInputFormat<LongWritable, Text>
    {
    /* the VCF header is stored here */
    private List<String> headerLines=new ArrayList<String>();

    @Override
    public RecordReader<LongWritable, Text> createRecordReader(InputSplit split,
            TaskAttemptContext context) throws IOException,
            InterruptedException {
        return new VcfRecordReader();
        }  
    @Override
    protected boolean isSplitable(JobContext context, Path filename) {
        return false;
        }

     private class VcfRecordReader extends LineRecordReader
        {
        /* reads all lines starting with '#' */
         @Override
        public void initialize(InputSplit genericSplit,
                TaskAttemptContext context) throws IOException {
            super.initialize(genericSplit, context);
            List<String> headerLines=new ArrayList<String>();
            while( super.nextKeyValue())
                {
                String row = super.getCurrentValue().toString();
                if(!row.startsWith("#")) throw new IOException("Bad VCF header");
                headerLines.add(row);
                if(row.startsWith("#CHROM")) break;
                }
            }
        }
    }

现在，在mapper中，有没有一种方法可以让指针指向 VcfInputFormat.this.headerLines 为了破译台词？

public static class VcfMapper
       extends Mapper<LongWritable, Text, Text, IntWritable>{

    public void map(LongWritable key, Text value, Context context ) throws IOException, InterruptedException {
      my.VcfCodec codec=new my.VcfCodec(???????.headerLines);
      my.Variant variant =codec.decode(value.toString());
      //(....)
    }
  }