数据库：mysql（innodb）ver 14.14 distrib 5.5.60，用于debian linux gnu（x86\u 64），使用readline 6.3
论坛帖子表大小：300万行
主查询（3个条件+1个订单）：

SELECT * FROM forum_posts WHERE deleted = 0 AND published = 1 AND 
show_homepage = 1 ORDER BY id DESC LIMIT 5 OFFSET 25;
5 rows in set (12.56 sec)

无订单查询（3个条件）

SELECT * FROM forum_posts WHERE deleted = 0 AND published = 1 AND 
show_homepage = 1 LIMIT 5 OFFSET 25;
5 rows in set (0.01 sec)

使用order by和where中的2个条件进行查询（已删除+显示\u主页）

SELECT * FROM forum_posts WHERE deleted = 0 AND show_homepage = 1 ORDER 
BY id DESC LIMIT 5 OFFSET 25;
5 rows in set (0.01 sec)

使用order by和where中仅有2个条件的查询（已删除+已发布）

SELECT * FROM forum_posts WHERE deleted = 0 AND published = 1 ORDER BY 
id DESC LIMIT 5 OFFSET 25;
5 rows in set (0.01 sec)

为什么主查询运行时间约为12秒？表中有所有4个字段的索引（3个字段来自条件，1个字段来自顺序）。
我还为3个字段和所有4个字段创建了计算索引。什么都帮不了。
请帮助理解问题的原因。