我有同样的pb：

Error in .local(drv, ...) : 
  Failed to connect to database: Error: Can't initialize character set unknown (path: compiled_in)

我尝试了hugo（修改my.ini）和davidguerin（使用rmariadb）的解决方案，但都不起作用。经过一些研究和经验，这个解决方案对我很有效
修改my.ini（这是要查找的路径 C:\ProgramData\MySQL\MySQL Server 8.0 ) :
与雨果的答案相反，你需要输入utf8mb4（utf8不是好的）
[客户]

default-character-set = utf8 (the old line "utf" to "utfmb4")
default-character-set = utf8mb4 (the new line with modification)

[mysql]数据库

default-character-set = utf8 (the old line "utf" to "utfmb4")
default-character-set = utf8mb4 (the new line with modification)

[我的qld]

character-set-client-handshake = FALSE  (new line to add)
character-set-server = utf8mb4  (the old line "utf" to "utfmb4")        
collation-server = utf8mb4_unicode_ci   (new line to add)
skip-character-set-client-handshake (Line to remove)

在mysql中，您需要更改密码：

ALTER USER root@localhost IDENTIFIED WITH mysql_native_password BY 'mot-passe';

与此问题相关的是，可以在本文中找到一个解决方案，它可以阻止您更改r首选库和/或降级mysql。
你只需要更改my.cnf设置。

我也有同样的问题。尝试更改架构上的字符集。还尝试用遗留的身份验证方法选项重新安装mysql，但rmysql仍然没有成功。
尝试了rmariadb包，它成功了。我会切换到rmariadb而不是降级mysql。
https://cran.r-project.org/web/packages/rmariadb/

我也遇到了这个问题，我注意到在最近发布的MySQL5.8中，服务器和客户端连接的默认字符集现在被默认设置为utf8mb4。在mysql 5.7中，默认字符集设置为utf8。
我试着使用服务器和客户端的字符集，将值还原为utf8，但我就是无法让它工作，所以我将安装的mysql还原为5.7。之后rmysql就开始工作了。
感觉rmysql目前无法支持utf8mb4，需要更新。

我这样解决这个问题：
用户窗口
1.error in.local（drv，…）：未能连接到数据库：错误：无法初始化未知字符集（路径：compiled\u in）
添加这些行之后：
文件路径： %PROGRAMDATA%\MySQL\MySQL Server X.X\my.ini ```
[mysqld]
collation-server = utf8_unicode_ci
init-connect='SET NAMES utf8'
character-set-server = utf8
skip-character-set-client-handshake

[client]
default-character-set   = utf8
[mysql]
default-character-set   = utf8

2-无法加载身份验证插件“caching\u sha2\u password”

ALTER USER 'yourusername'@'localhost' IDENTIFIED WITH mysql_native_password BY 'youpassword';

参考文献：
mysql my.ini位置
在my.cnf中将mysql默认字符集更改为utf-8？
无法加载身份验证插件“caching\u sha2\u password”