如何使用jdbc/hive构建运行闪亮应用程序的dockerfile(需要rjava)？

n9vozmp4 于 2021-06-24 发布在 Hive

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我需要一个dockerfile来运行一个闪亮的应用程序能够连接到使用jdbc的配置单元。包rjdbc依赖于包rjava，因此是java。现在，我测试了多种选择：
以rocker/verse为例，其中包含java，并手动添加shiny。
使用rocker/shiny，手动添加java。
两种方案都部分奏效，但并不完全奏效。配置单元连接的r代码如下：

require(RJDBC)
urlJDBC = "jdbc:hive2://...:8443/;ssl=true;sslTrustStore=./cacerts;trustStorePassword=changeit?hive.server2.transport.mode=http;hive.server2.thrift.http.path=gateway/default/hive"
driver = JDBC("org.apache.hive.jdbc.HiveDriver", "hive-jdbc-standalone.jar", identifier.quote="`")
con = dbConnect(driver, urlJDBC, "username", "password")

我还在dockerfile中添加了jdbcjar文件，行为：

ADD ... ./hive-jdbc-standalone.jar

然而，我没有成功使它运行。是否有人有一个blueproint dockerfile，它可以与shiny和hive/jdbc一起工作？那太好了
米

Hive docker r shiny rjdbc

来源：https://stackoverflow.com/questions/56473165/how-to-build-a-dockerfile-which-runs-a-shiny-app-using-jdbc-hive-needs-rjava

1条答案

按热度按时间

hc2pp10m1#

在几个小时的错误方向上解决了。
问题出在权限管理上。缺少对jar文件的读取权限。
新dockerfile非常简单：

FROM rocker/shiny

# Download and rename JAR file with JDBC HIVE driver.

WORKDIR /srv/shiny-server/apps/shinyhive
ADD <..jar-on-local-server..> ./hive-jdbc-standalone.jar

RUN apt-get update && apt-get install -y \
    openjdk-8-jdk liblzma-dev libbz2-dev libicu-dev libssl-dev \
    && R CMD javareconf

RUN R -e "install.packages('RJDBC', repos='http://cran.r-project.org')"

RUN chmod 777 -R .
COPY . .
COPY ./shiny-server.sh /usr/bin/shiny-server.sh

EXPOSE 3838

CMD ["/usr/bin/shiny-server.sh"]

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