我建议使用jacoco，因为它不需要修改源代码。查看使用greybox工具测量（tomcat）java应用程序中的代码覆盖率

好吧，所有代码覆盖工具都使用相同的概念（我将省略报告和检查部分）：
首先输入代码（即放置标记）。
然后运行测试以执行插入指令的代码（激活标记并收集数据）。
对于第二步，常见的用例确实是运行junit测试，但是您的测试不必是junit测试。实际上，它们甚至不需要自动化。
而且插入指令的代码不必在单元测试的上下文中执行，它可以打包在war/ear中并部署在容器上（这只需要更多的工作）。
对于cobertura，这是我们在常见问题解答中可以看到的：

在web应用程序中使用cobertura

我有使用httpunit/htmlunit/empirix/rational robot的自动化测试，我可以使用cobertura吗？
对！这个过程有点复杂，但概念是一样的。首先给编译好的类装上乐器。然后创建war文件。然后将war文件部署到应用服务器（tomcat、jboss、weblogic、websphere等）。现在运行测试。
当您的类被访问时，它们将在磁盘上创建一个“cobertura.ser”文件。你可能需要四处挖掘才能找到它。cobertura将此文件放在它认为是当前工作目录的位置。通常，这是启动应用程序服务器的目录（例如，c:\tomcat\bin）。注意：在应用程序服务器退出之前，不会将此文件写入磁盘。有关如何解决此问题，请参见下文。
既然知道了cobertura.ser文件的位置，就应该修改部署步骤，以便将原始的cobertura.ser移到应用程序服务器中的相应目录中，然后在完成测试后将其移回。然后运行cobertura报告。
[...]
对艾玛来说，文件上是这么说的：
3.11. 如何在{weblogic，websphere，tomcat，jboss，…}中使用emma？
首先，对于一个成熟的j2ee容器，使用动态模式（emmarun）的可能性很小。原因在于许多j2ee特性需要专门的类加载，这将发生在emma检测类加载程序之外。服务器可能运行良好，但可能得不到覆盖率数据。
因此，正确的过程是在部署（脱机模式）之前对类进行指令插入。脱机插装始终遵循相同的编译/instrument/package/deploy/get coverage/generate reports序列。遵循以下步骤：
使用emma的instr工具来插入所需的类。这可以在打包之前作为编译后的步骤来完成。然而，许多用户也发现让emma直接处理jar很方便（要么就地，使用覆盖模式，要么在fullcopy模式下创建所有内容的单独检测副本）；
像平常一样进行j2ee打包，但不要将emma.jar作为lib包含在这个级别，也就是说，在.war、.ear等中；
找到容器使用的jre，并将emma.jar复制到其/lib/ext目录中。如果不可能，则将emma.jar添加到服务器类路径（以特定于服务器的方式）；
部署插入指令的类、.jar、.wars、.ear等，并通过客户端测试用例或以交互方式或以任何方式来练习/测试j2ee应用程序；
要获取覆盖率转储文件，您有三个选项，如emma转储运行时覆盖率数据时控制哪些选项中所述？。强烈建议将coverage.get control命令与v2.1中提供的ctl工具一起使用。
对于clover，请查看使用分布式应用程序页面。

我使用与单元测试项目构建阶段集成的emma覆盖工具，然而，该工具的文档说，在您描述的情况下获得代码覆盖相当简单。

代码封面是一个很好的工具。对于您的情况，您应该使用命令行界面，该界面可能与现有的powershell脚本合并。