你想这样做吗？

WITH c AS (
      SELECT count(*) AS cnt
      FROM table
      WHERE ESTNUMBER = 1187216 AND CODE = 1208
     )
SELECT s1.*
FROM subquery1 s1
WHERE (SELECT cnt FROM c) = 0
UNION ALL
SELECT s2.*
FROM subquery2 s2
WHERE (SELECT cnt FROM c) > 0;

这假设子查询返回的列是兼容的（相同的数目，相同的类型）。
有更好的方法来编写这个查询（特别是使用 EXISTS 以及 NOT EXISTS )，但这与你提问的方式完全一致。

字符串值应该出现在select子句中，而不是where筛选器中。

SELECT
  count(*) AS t,
(CASE WHEN count(*) = 0 THEN 'it is zero' ELSE 'it is not zero' END) display_str
FROM
  table
WHERE
  (
    ESTNUMBER = 1187216
    AND CODE = 1208
  )

你像一个命令式的程序员，而不是一个声明式的。也就是说，sql没有顺序执行：要么全部执行，要么什么都不执行。
所以，这是一个开始，有效的一点：

SELECT count(*) AS t
  FROM table
  WHERE ESTNUMBER = 1187216 AND CODE = 1208

现在，为了检查count（）的值，您现在知道where将不起作用。那是因为count是一个聚合函数。为了观察这种函数的结果，你使用having。
为了使您的案例有效，您可以将其移动到可以获得count（）结果的区域：

SELECT count(*) AS t
    (CASE WHEN count(*) = 0 THEN 'it is zero' ELSE 'it is not zero' END) as msg
  FROM table
  WHERE ESTNUMBER = 1187216 AND CODE = 1208

请注意，“t”是您给出count（*）结果的别名。在大多数sql实现中，该别名不能在语句的其余部分使用。
现在，对于非此即彼的事情，是时候重新考虑你的方法和你真正想要的了。您可能最终会在语句中包含这两个结果集，并选择如何提供结果。
比如：

select a.id, a.ct, (case when a.ct=0 then b.amt else c.amt end) as amt
  from (select id, count(*) as ct from table1) a
    left join (select id, sum(amount) as amt from table2) b on a.id=b.id
    left join (select id, sum(amount) as amt from table3) c on a.id=c.id

希望这有帮助。