Pandas合并101只

xtupzzrd  于 2022-09-21  发布在  其他
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  • 如何对Pandas进行(INNER|(LEFT|RIGHT|FULL)OUTER)JOIN
  • 如何在合并后为缺少的行添加NAN?
  • 合并后如何摆脱NAN?
  • 我可以在索引上合并吗?
  • 如何合并多个DataFrame?
  • 与Pandas交叉加入
  • mergejoinconcatupdate?谁?什么?为什么?!

..。还有更多。我见过这些反复出现的问题,询问Pandas合并功能的各个方面。今天,关于Merge及其各种用例的大部分信息都分散在数十篇措辞拙劣、无法搜索的帖子中。这里的目的是为子孙后代整理一些更重要的观点。

这篇问答是关于Pandas常见习语的一系列有用的用户指南中的下一篇(参见this post on pivotingthis post on concatenation,我将在后面讨论它们)。

请注意,这篇文章并不是要取代the documentation,所以请也读一读!其中一些例子就是从那里取来的。

目录

为了便于访问。

ubbxdtey

ubbxdtey1#

这篇文章旨在为读者提供一本关于与Pandas合并的入门读物,如何使用它,以及何时不使用它。

特别是,以下是这篇帖子将经历的:

  • 基础-连接类型(左、右、外、内)

  • 合并不同列名

  • 合并多列

  • 避免在输出中出现重复的合并键列

这篇帖子(以及我在这个帖子上的其他帖子)不会经历的:

  • 与业绩有关的讨论和时间安排(目前)。最值得注意的是,在适当的地方提到了更好的替代方案。
  • 处理后缀、删除多余的列、重命名输出以及其他特定用例。还有其他(阅读:更好的)帖子来处理这个问题,所以想办法吧!
    除非另有说明,否则大多数示例在演示各种功能时默认使用内连接操作。

此外,这里的所有DataFrame都可以复制和复制,这样您就可以玩它们了。此外,请参阅this post以了解如何从剪贴板中读取DataFrame。

最后,连接操作的所有可视化表示都是使用Google Drawing手绘的。灵感来自here

说够了--教我怎么用merge就行了!

设置与基础

np.random.seed(0)
left = pd.DataFrame({'key': ['A', 'B', 'C', 'D'], 'value': np.random.randn(4)})
right = pd.DataFrame({'key': ['B', 'D', 'E', 'F'], 'value': np.random.randn(4)})

left

  key     value
0   A  1.764052
1   B  0.400157
2   C  0.978738
3   D  2.240893

right

  key     value
0   B  1.867558
1   D -0.977278
2   E  0.950088
3   F -0.151357

为简单起见,键列具有相同的名称(目前)。

内部联接

这一点以及即将公布的数字都遵循这一惯例:

  • 蓝色**表示合并结果中存在的行
  • 红色**表示从结果中排除(即删除)的行
  • 绿色**表示结果中替换为NaNs的缺失值

要执行内部联接,请在左边的DataFrame上调用merge,并将右边的DataFrame和联接键(至少)指定为参数。

left.merge(right, on='key')

# Or, if you want to be explicit

# left.merge(right, on='key', how='inner')

  key   value_x   value_y
0   B  0.400157  1.867558
1   D  2.240893 -0.977278

这只返回leftright中共享公用键(在本例中为“B”和“D”)的行。

左外部联接,或左联接由表示

这可以通过指定how='left'来执行。

left.merge(right, on='key', how='left')

  key   value_x   value_y
0   A  1.764052       NaN
1   B  0.400157  1.867558
2   C  0.978738       NaN
3   D  2.240893 -0.977278

请仔细注意此处放置的NaN。如果指定how='left',则只使用left中的密钥,而right中缺少的数据将替换为NaN。

同样,对于右外部联接,或右联接,它是...

...指定how='right'

left.merge(right, on='key', how='right')

  key   value_x   value_y
0   B  0.400157  1.867558
1   D  2.240893 -0.977278
2   E       NaN  0.950088
3   F       NaN -0.151357

这里使用了right中的密钥,并用NaN替换了left中缺失的数据。

最后,对于完全外连接,由

指定how='outer'

left.merge(right, on='key', how='outer')

  key   value_x   value_y
0   A  1.764052       NaN
1   B  0.400157  1.867558
2   C  0.978738       NaN
3   D  2.240893 -0.977278
4   E       NaN  0.950088
5   F       NaN -0.151357

这使用了两个帧中的关键点,并为这两个帧中缺少的行插入了NAN。

文档很好地总结了这些不同的合并:

其他联接--左排除、右排除、全排除/反联接

如果您需要左排除JOIN右排除JOIN两个步骤。

对于左排除联接,表示为

首先执行左外部联接,然后只过滤来自left的行(排除来自右侧的所有行),

(left.merge(right, on='key', how='left', indicator=True)
     .query('_merge == "left_only"')
     .drop('_merge', 1))

  key   value_x  value_y
0   A  1.764052      NaN
2   C  0.978738      NaN

哪里,

left.merge(right, on='key', how='left', indicator=True)

  key   value_x   value_y     _merge
0   A  1.764052       NaN  left_only
1   B  0.400157  1.867558       both
2   C  0.978738       NaN  left_only
3   D  2.240893 -0.977278       both

类似地,对于排除权限的联接,

(left.merge(right, on='key', how='right', indicator=True)
     .query('_merge == "right_only"')
     .drop('_merge', 1))

  key  value_x   value_y
2   E      NaN  0.950088
3   F      NaN -0.151357

最后,如果需要进行只保留来自左侧或右侧的键的合并,而不是同时保留这两个键(IOW,执行反联接),

你可以用类似的方式来做这个-

(left.merge(right, on='key', how='outer', indicator=True)
     .query('_merge != "both"')
     .drop('_merge', 1))

  key   value_x   value_y
0   A  1.764052       NaN
2   C  0.978738       NaN
4   E       NaN  0.950088
5   F       NaN -0.151357

键列名称不同

如果键列的名称不同-例如,left具有keyLeft,而right具有keyRight而不是key-则必须指定left_onright_on作为参数,而不是on

left2 = left.rename({'key':'keyLeft'}, axis=1)
right2 = right.rename({'key':'keyRight'}, axis=1)

left2

  keyLeft     value
0       A  1.764052
1       B  0.400157
2       C  0.978738
3       D  2.240893

right2

  keyRight     value
0        B  1.867558
1        D -0.977278
2        E  0.950088
3        F -0.151357
left2.merge(right2, left_on='keyLeft', right_on='keyRight', how='inner')

  keyLeft   value_x keyRight   value_y
0       B  0.400157        B  1.867558
1       D  2.240893        D -0.977278

输出避免重复键列

合并left中的keyLeftright中的keyRight时,如果您只需要输出中的keyLeftkeyRight中的一个(而不是两者),则可以首先设置索引作为初步步骤。

left3 = left2.set_index('keyLeft')
left3.merge(right2, left_index=True, right_on='keyRight')

    value_x keyRight   value_y
0  0.400157        B  1.867558
1  2.240893        D -0.977278

将其与前面命令的输出(即left2.merge(right2, left_on='keyLeft', right_on='keyRight', how='inner')的输出)进行对比,您会注意到缺少keyLeft。您可以根据将哪个帧的索引设置为键来确定要保留哪一列。比方说,当执行某些外部联接操作时,这可能很重要。

只合并DataFrames中的一列

例如,考虑

right3 = right.assign(newcol=np.arange(len(right)))
right3
  key     value  newcol
0   B  1.867558       0
1   D -0.977278       1
2   E  0.950088       2
3   F -0.151357       3

如果您只需要合并“NEWCOL”(不合并任何其他列),您通常可以在合并之前只对列进行子集:

left.merge(right3[['key', 'newcol']], on='key')

  key     value  newcol
0   B  0.400157       0
1   D  2.240893       1

如果您正在执行左外部联接,则性能更好的解决方案将涉及map


# left['newcol'] = left['key'].map(right3.set_index('key')['newcol']))

left.assign(newcol=left['key'].map(right3.set_index('key')['newcol']))

  key     value  newcol
0   A  1.764052     NaN
1   B  0.400157     0.0
2   C  0.978738     NaN
3   D  2.240893     1.0

如前所述,这类似于,但比

left.merge(right3[['key', 'newcol']], on='key', how='left')

  key     value  newcol
0   A  1.764052     NaN
1   B  0.400157     0.0
2   C  0.978738     NaN
3   D  2.240893     1.0

多列合并

要联接多个列,请为on(或left_onright_on,视情况而定)指定列表。

left.merge(right, on=['key1', 'key2'] ...)

或者,如果名字不同,

left.merge(right, left_on=['lkey1', 'lkey2'], right_on=['rkey1', 'rkey2'])

其他有用的merge*操作和函数

本部分仅涵盖最基本的内容,旨在满足您的胃口。有关更多示例和用例,请参阅documentation on merge, join, and concat以及指向功能规范的链接。

继续阅读

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h7wcgrx3

h7wcgrx32#

pd.concat([df0, df1], kwargs)的补充视觉视图。请注意,kwarg axis=0axis=1的含义不像df.mean()df.apply(func)那样直观

8ehkhllq

8ehkhllq3#

加入101

这些动画可能会更好地从视觉上解释你。片酬:Garrick Aden-Buie tidyexplain repo

内联接

外联接或全联接

右联

左联接

qojgxg4l

qojgxg4l4#

在这个回答中,我将考虑实际例子。

第一个是pandas.concat

第二种是将一个索引中的 Dataframe 与另一个索引中的列进行合并。

1pandas.concat

考虑以下具有相同列名的DataFrames

2018年前大小(8784,5)

Preco 2019,大小(8760,5)

具有相同列名的。

您可以使用pandas.concat将它们组合在一起,只需

import pandas as pd

frames = [Preco2018, Preco2019]

df_merged = pd.concat(frames)

这会产生一个大小如下的DataFrame(17544,5)

如果你想形象化,它最终是这样工作的

(Source)

2。按列和索引合并

在这一部分中,我将考虑一个具体的案例:如果想要合并一个 Dataframe 的索引和另一个 Dataframe 的列。

假设其中一个 Dataframe Geo具有54列,是日期Data列之一,其类型为datetime64[ns]

和 Dataframe Price,其中有一列包含价格,索引对应于日期

在本例中,要合并它们,可以使用pd.merge

merged = pd.merge(Price, Geo, left_index=True, right_on='Data')

这会产生以下 Dataframe

lf5gs5x2

lf5gs5x25#

这篇文章将涉及以下主题:

  • 在不同条件下与指数合并

  • 基于索引的联接选项:mergejoinconcat

  • 对索引进行合并

  • 对一个索引、另一个列进行合并

  • 有效地使用命名索引简化合并语法

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基于索引的联接

TL;DR

有几个选项,根据用例的不同,有些选项比其他选项更简单。

  • 使用left_indexright_indexDataFrame.merge(或使用命名索引的left_onright_on)

  • 支持内/左/右/全

  • 一次只能加入两个

  • 支持列-列、索引-列、索引-索引联接

  • DataFrame.join(索引联接)

  • 支持内/左(默认)/右/全

  • 一次可以加入多个DataFrame

  • 支持索引-索引联接

  • pd.concat(索引联接)

  • 支持内部/完全(默认)

  • 一次可以加入多个DataFrame

  • 支持索引-索引联接

索引到索引联接

设置与基础知识

import pandas as pd
import numpy as np

np.random.seed([3, 14])
left = pd.DataFrame(data={'value': np.random.randn(4)}, 
                    index=['A', 'B', 'C', 'D'])    
right = pd.DataFrame(data={'value': np.random.randn(4)},  
                     index=['B', 'D', 'E', 'F'])
left.index.name = right.index.name = 'idxkey'

left
           value
idxkey          
A      -0.602923
B      -0.402655
C       0.302329
D      -0.524349

right

           value
idxkey          
B       0.543843
D       0.013135
E      -0.326498
F       1.385076

通常,索引上的INTER JOIN如下所示:

left.merge(right, left_index=True, right_index=True)

         value_x   value_y
idxkey                    
B      -0.402655  0.543843
D      -0.524349  0.013135

其他联接遵循类似的语法。

值得注意的替代方案

1.**DataFrame.join**默认为索引联接。默认情况下,DataFrame.join执行左外部联接,因此这里需要how='inner'

left.join(right, how='inner', lsuffix='_x', rsuffix='_y')

          value_x   value_y
 idxkey                    
 B      -0.402655  0.543843
 D      -0.524349  0.013135

请注意,我需要指定lsuffixrsuffix参数,否则join将出错:

left.join(right)
 ValueError: columns overlap but no suffix specified: Index(['value'], dtype='object')

因为列名是相同的。如果它们的名字不同,这不会是一个问题。

left.rename(columns={'value':'leftvalue'}).join(right, how='inner')

         leftvalue     value
 idxkey                     
 B       -0.402655  0.543843
 D       -0.524349  0.013135

1.**pd.concat**连接索引,一次可以连接两个或多个DataFrame。默认情况下,它执行完全的外连接,因此这里需要how='inner'

pd.concat([left, right], axis=1, sort=False, join='inner')

            value     value
 idxkey                    
 B      -0.402655  0.543843
 D      -0.524349  0.013135

有关concat的更多信息,请参阅此帖子。

列联接索引

要使用左列右列的索引执行内连接,您将使用DataFrame.mergeleft_index=Trueright_on=...的组合。

right2 = right.reset_index().rename({'idxkey' : 'colkey'}, axis=1)
right2

  colkey     value
0      B  0.543843
1      D  0.013135
2      E -0.326498
3      F  1.385076

left.merge(right2, left_index=True, right_on='colkey')

    value_x colkey   value_y
0 -0.402655      B  0.543843
1 -0.524349      D  0.013135

其他连接遵循类似的结构。请注意,只有merge可以执行索引到列的联接。如果左侧的索引级数等于右侧的列数,则可以联接多个列。

joinconcat不能混合合并。您需要使用DataFrame.set_index将索引设置为前置步骤。

有效使用命名索引[Pandas>=0.23]

如果您的索引已命名,则从PANDA>=0.23开始,DataFrame.merge允许您将索引名指定为on(或根据需要指定left_onright_on)。

left.merge(right, on='idxkey')

         value_x   value_y
idxkey                    
B      -0.402655  0.543843
D      -0.524349  0.013135

对于前面与索引Left,Column of Right合并的示例,您可以使用索引名称为Left的left_on

left.merge(right2, left_on='idxkey', right_on='colkey')

    value_x colkey   value_y
0 -0.402655      B  0.543843
1 -0.524349      D  0.013135

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qlzsbp2j

qlzsbp2j6#

这篇文章将涉及以下主题:

  • 如何正确泛化到多个DataFrame(为什么merge在这里有缺点)
  • 在唯一键上合并
  • 在非唯一键上合并

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泛化为多个DataFrame

通常,当要将多个DataFrame合并在一起时会出现这种情况。很简单,这可以通过链接merge调用来实现:

df1.merge(df2, ...).merge(df3, ...)

然而,对于许多DataFrame来说,这很快就失去了控制。此外,可能有必要对未知数量的DataFrame进行概括。

在这里,我介绍pd.concat用于唯一键上的多路联接,DataFrame.join用于非唯一键上的多路联接。首先,是设置。


# Setup.

np.random.seed(0)
A = pd.DataFrame({'key': ['A', 'B', 'C', 'D'], 'valueA': np.random.randn(4)})    
B = pd.DataFrame({'key': ['B', 'D', 'E', 'F'], 'valueB': np.random.randn(4)})
C = pd.DataFrame({'key': ['D', 'E', 'J', 'C'], 'valueC': np.ones(4)})
dfs = [A, B, C] 

# Note: the "key" column values are unique, so the index is unique.

A2 = A.set_index('key')
B2 = B.set_index('key')
C2 = C.set_index('key')

dfs2 = [A2, B2, C2]

唯一键多路合并

如果您的键(这里的键可以是列或索引)是唯一的,则可以使用pd.concat。请注意,pd.concat在索引上加入DataFrames


# Merge on `key` column. You'll need to set the index before concatenating

pd.concat(
    [df.set_index('key') for df in dfs], axis=1, join='inner'
).reset_index()

  key    valueA    valueB  valueC
0   D  2.240893 -0.977278     1.0

# Merge on `key` index.

pd.concat(dfs2, axis=1, sort=False, join='inner')

       valueA    valueB  valueC
key                            
D    2.240893 -0.977278     1.0

对于完全外部联接,省略join='inner'。请注意,您不能指定左连接或右连接(如果需要,请使用join,如下所述)。

重复键多路合并

concat速度快,但也有缺点。它不能处理重复项。

A3 = pd.DataFrame({'key': ['A', 'B', 'C', 'D', 'D'], 'valueA': np.random.randn(5)})
pd.concat([df.set_index('key') for df in [A3, B, C]], axis=1, join='inner')
ValueError: Shape of passed values is (3, 4), indices imply (3, 2)

在这种情况下,我们可以使用join,因为它可以处理非唯一键(请注意,join在它们的索引上联接DataFrame;它在幕后调用merge并执行左外部联接,除非另有指定)。


# Join on `key` column. Set as the index first.

# For inner join. For left join, omit the "how" argument.

A.set_index('key').join([B2, C2], how='inner').reset_index()

  key    valueA    valueB  valueC
0   D  2.240893 -0.977278     1.0

# Join on `key` index.

A3.set_index('key').join([B2, C2], how='inner')

       valueA    valueB  valueC
key                            
D    1.454274 -0.977278     1.0
D    0.761038 -0.977278     1.0

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ssgvzors

ssgvzors7#

Pandas目前不支持合并语法中的不平等连接;一个选项是使用pyjanitor中的CONDITIONAL_JOIN函数-我是这个库的贡献者:


# pip install pyjanitor

import pandas as pd
import janitor 

left.conditional_join(right, ('value', 'value', '>'))

   left           right
    key     value   key     value
0     A  1.764052     D -0.977278
1     A  1.764052     F -0.151357
2     A  1.764052     E  0.950088
3     B  0.400157     D -0.977278
4     B  0.400157     F -0.151357
5     C  0.978738     D -0.977278
6     C  0.978738     F -0.151357
7     C  0.978738     E  0.950088
8     D  2.240893     D -0.977278
9     D  2.240893     F -0.151357
10    D  2.240893     E  0.950088
11    D  2.240893     B  1.867558

left.conditional_join(right, ('value', 'value', '<'))

  left           right
   key     value   key     value
0    A  1.764052     B  1.867558
1    B  0.400157     E  0.950088
2    B  0.400157     B  1.867558
3    C  0.978738     B  1.867558

这些列作为元组的变量参数传递,每个元组由左 Dataframe 中的列、右 Dataframe 中的列和联接操作符组成,连接操作符可以是(>, <, >=, <=, !=)中的任何一个。在上面的示例中,由于列名重叠,返回了一个多索引列。

在性能方面,这比幼稚的交叉连接要好:

np.random.seed(0)
dd = pd.DataFrame({'value':np.random.randint(100000, size=50_000)})
df = pd.DataFrame({'start':np.random.randint(100000, size=1_000), 
                   'end':np.random.randint(100000, size=1_000)})

dd.head()

   value
0  68268
1  43567
2  42613
3  45891
4  21243

df.head()

   start    end
0  71915  47005
1  64284  44913
2  13377  96626
3  75823  38673
4  29151    575

%%timeit
out = df.merge(dd, how='cross')
out.loc[(out.start < out.value) & (out.end > out.value)]
5.12 s ± 19 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

%timeit df.conditional_join(dd, ('start', 'value' ,'<'), ('end', 'value' ,'>'))
280 ms ± 5.56 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

out = df.merge(dd, how='cross')
out = out.loc[(out.start < out.value) & (out.end > out.value)]
A = df.conditional_join(dd, ('start', 'value' ,'<'), ('end', 'value' ,'>'))
columns = A.columns.tolist()
A = A.sort_values(columns, ignore_index = True)
out = out.sort_values(columns, ignore_index = True)

A.equals(out)
True
ccrfmcuu

ccrfmcuu8#

我认为你应该在你的解释中包括这一点,因为这是一种我经常看到的相关合并,我认为它被称为cross-join。这是当唯一的df没有共享列时发生的合并,它只是并排合并2个df:

设置:

names1 = [{'A':'Jack', 'B':'Jill'}]

names2 = [{'C':'Tommy', 'D':'Tammy'}]

df1=pd.DataFrame(names1)
df2=pd.DataFrame(names2)
df_merged= pd.merge(df1.assign(X=1), df2.assign(X=1), on='X').drop('X', 1)

这将创建一个虚拟的X列,在X上合并,然后将其删除以生成

DF_MERMERED:

A     B      C      D
0  Jack  Jill  Tommy  Tammy

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