在这里帮助你很难，因为你把ember和git混合在一起，而它们实际上是不相关的。
关于ember-cli-update.json：您不应该编辑它，outputRepo是指ember-cli-upgrade将从新成员应用程序的输出中升级您的应用程序。
现在，还要尽量避免混合使用git和github。Github是git的在线平台，但您在本地使用的工具git与github无关。反之亦然：Github是git的平台，而不是git是Github的工具。
我不确定您是如何创建git回购的，但这里有一个重要的东西：默认情况下，ember new生成git repo！现在我想你的问题可能是：

• 您在/workspace中创建了一个名为currentproject的新ember项目，*之前，/workspace有一个git存储库。
• 这创建了新文件夹/workspace/currentproj，这是一个git存储库。
• 然后您为/workspace创建了一个git存储库，现在您有两个嵌套的git存储。

要调查这一点，必须了解一件事：git存储库是一个包含.git文件夹的文件夹。没有别的，没有魔法。这是如何移动包含回购的文件夹的方法。
我建议检查是否有/workspace/currentproj/.git文件夹。如果有，您可能可以安全地删除它，因为您希望git对该子文件夹使用/workspace/.git repo。
如果这不是你的问题，另一个问题可能是，git status不会列出没有跟踪文件的文件夹。您将只看到文件夹。然而，git add --all应该添加这些文件，因此这也可能是一个问题。
通常，在对git进行故障排除时，最好查找.git文件夹并调查git status和git log的输出。在您的情况下，您可以从/workspace与/workspace/currentproj中运行这些命令并进行比较以进行调查。