至少从PyCharm 2017.2开始，您可以通过启用以下功能来实现：
执行|编辑配置...|组态设定|在输出控制台中仿真终端

PyCharm本身并不支持这个特性，但是你可以下载Grep Console plugin并设置你喜欢的颜色。
以下是截图：http://plugins.jetbrains.com/files/7125/screenshot_14104.png（链路失效）
我希望它能有所帮助：）虽然它没有提供完全彩色的控制台，但它是朝着它迈出的一步。

迟到了，但任何人与这个问题，这里的解决方案，为我工作：

import logging
import sys
logging.basicConfig(stream=sys.stdout, level=logging.DEBUG)

这来自于这个答案

2019年9月：PyCharm社区2019.1

PyCharm将所有日志（包括信息/调试）着色为红色。
结果是：这不是PyCharm的问题，这是默认的logging的配置方式。PyCharm将写入sys.stderr的所有内容标为红色。当使用不带参数的StreamHandler()时，默认流为sys.stderr。
要获取非彩色日志，请在基本配置中指定logging.StreamHandler(stream=sys.stdout)，如下所示：

logging.basicConfig(
    level=logging.DEBUG,
    format='[%(levelname)8s]:  %(message)s',
    handlers=[
        logging.FileHandler(f'{os.path.basename(__file__)}.log'),
        logging.StreamHandler(sys.stdout),
    ])

或者更详细：

logging.getLogger().addHandler(logging.StreamHandler(stream=sys.stdout))

这修复了我的红色PyCharm日志。

我解决这个问题的方法（在PyCharm 2017.2中）是转到Preferences -> Editor -> Color Scheme -> Console Colors并改变Console -> Error output的颜色。当然，这也改变了错误的颜色，但至少你不会一直看到红色。

PyCharm 2019.1.1（Windows 10，1709）-按原样运行snippet-工作正常。

错误：setFormatter -不起作用。
修复：在第67行进行更改，并在第70-71行删除（添加未格式化的处理程序）。

self.stream.write(record.msg + "\n", color)

至

self.stream.write(self.format(record) + "\n", color)

第70-71行可移至手动文件下运行构造，以保存测试能力：

if __name__ == "__main__":
    logging.getLogger().setLevel(logging.DEBUG)
    logging.getLogger().addHandler(ColorHandler())

    logging.debug("Some debugging output")
    logging.info("Some info output")
    logging.error("Some error output")
    logging.warning("Some warning output")

将其与标准StreamHandler进行比较：

import logging
import logging_colored

log_format = logging.Formatter("[%(threadName)-15.15s] [%(levelname)-5.5s]  %(message)s")
logger = logging.getLogger('Main')
logger.setLevel(logging.DEBUG)

console = logging.StreamHandler()
console.setFormatter(log_format)
logger.addHandler(console)

console = logging_colored.ColorHandler()
console.setFormatter(log_format)
logger.addHandler(console)
...

我发现了下面的解决方案。显然Pycharm从sys module documentation重定向sys.stdout：

sys.__stdin__
sys.__stdout__
sys.__stderr__

这些对象在程序开始时包含stdin、stderr和stdout的原始值。它们在终止过程中使用，并且无论sys.std* 对象是否被重定向，都可以用于打印到实际的标准流。
如果实际文件被损坏的对象覆盖，它还可以用于将实际文件还原为已知的工作文件对象。但是，执行此操作的首选方法是在替换之前显式保存以前的流，然后还原保存的对象。
因此，要解决这个问题，您可以将输出重定向到sys.__stdout__。示例配置来自我的log_config.yml：

console:
  class: logging.StreamHandler
  level: DEBUG
  stream: "ext://sys.__stdout__"
  formatter: colorFormatter