$ touch /home/tzfeng/test_files/{A,B,C}_{1,2}.fq.gz
$ nextflow run main.nf
N E X T F L O W ~ version 22.10.0
Launching `main.nf` [sharp_borg] DSL2 - revision: 3461b43146
[A, [/home/tzfeng/test_files/A_1.fq.gz, /home/tzfeng/test_files/A_2.fq.gz]]
[B, [/home/tzfeng/test_files/B_1.fq.gz, /home/tzfeng/test_files/B_2.fq.gz]]
[C, [/home/tzfeng/test_files/C_1.fq.gz, /home/tzfeng/test_files/C_2.fq.gz]]
1条答案
按热度按时间hmtdttj41#
这是因为 params.reads 只是一个常规的
java.lang.String
,而您需要的是一个Channel。如果您需要一个通道来发出文件对,您可以使用fromFilePairs工厂方法来获取一个元组,该元组包含作为第一个元素的组键,以及作为第二个元素的与glob模式匹配的文件列表:结果: