您可以从相依性中排除具有“错误”版本的程式库。

dependencies {
    implementation("some-library") {
        exclude(group = "com.example.imgtools", module = "native")
    }
}

其实我自己就能解决这个问题。
本质上，我需要做的是在我的gradle文件中添加一个任务，在合并库任务运行之前将其拦截，并删除不需要的库：

tasks.whenTaskAdded((tas -> {
    if (tas.name.contains("mergeDebugNativeLibs")) {
        tasks.named("mergeDebugNativeLibs") {it
            doFirst {
                java.nio.file.Path notNeededDirectory = it.externalLibNativeLibs
                    .getFiles()
                    .stream()
                    .filter(file -> file.toString().contains("Metadata"))
                    .findAny()
                    .orElse(null)
                    .toPath();
                Files.walk(notNeededDirectory).forEach(file -> {
                    if (file.toString().contains("libav") || file.toString().contains("libsw")) {
                        Files.delete(file);
                    }
                });
            }
        }
    }
    if (tas.name.contains("mergeReleaseNativeLibs")) {
        tasks.named("mergeReleaseNativeLibs") {it
            doFirst {
                java.nio.file.Path notNeededDirectory = it.externalLibNativeLibs
                        .getFiles()
                        .stream()
                        .filter(file -> file.toString().contains("Metadata"))
                        .findAny()
                        .orElse(null)
                        .toPath();
                Files.walk(notNeededDirectory).forEach(file -> {
                    if (file.toString().contains("libav") || file.toString().contains("libsw")) {
                        Files.delete(file);
                    }
                });
            }
        }
    }
}))

在这种情况下，不需要的库位于FFmpegMetadataMediaRetriever文件夹/库中。