谢谢Govind，你给了我一个开始，我想我找到了问题，因为我不知道neo4j运行的某个pid与/var/run/neo4j/ www.example.com中生成的pid不同neo4j.pid，当我用正在运行的pid覆盖neo4j.pid时，我能够停止neo4j并启动一个干净的进程。

听起来运行neo4j status和neo4j stop命令的计算机与运行neo4j浏览器服务的计算机不一样。
如果你想控制neo4j浏览器服务，你需要在正确的机器上运行这些命令。

您是否以root用户身份运行neo4j status？有时，当您以非root用户身份运行neo4j status，而以root用户身份启动它时，它会给予您该消息。

我正在使用“Ubuntu 18.04.3 LTS”和“neo4j-community-3.5.8”。当我进入neo4j的主目录时（我直接从网站下载）

我只是偶然发现了同样的问题，即neo4j进程正在运行，但neo4j status却不是这样说的。
在我的例子中，这是由于在初始安装/配置过程中的一个事故，导致没有运行文件夹得到创建：由于neo4j PID文件存储在/var/run/neo4j中，因此neo4j status认为该进程没有运行，尽管实际上该进程正在运行。
我能够通过手动终止进程并再次启动neo4j来确认该行为，之后我看到了：

....
Starting Neo4j.
/usr/share/neo4j/bin/neo4j: line 451: /var/run/neo4j/neo4j.pid: No such file or directory

在为neo4j创建run文件夹后，问题就消失了，方法是使用简单的：

(sudo) mkdir /var/run/neo4j

我在使用最新的GCP公共图像neo4j-community-1-4-3-6-apoc时遇到了这个问题，该图像使用的是Neo4j Community 4.3.6。
启动行为是status命令认为Neo4j未运行：

$ /usr/share/neo4j/bin/neo4j status
Neo4j is not running.

因此，尝试stop不会执行任何动作，因为系统认为它一开始就没有执行：

$ sudo /usr/share/neo4j/bin/neo4j stop
Neo4j is not running.

但应用程序显然正在运行，curl输出证明了这一点：

$ curl http://localhost:7474/
{
  "bolt_routing" : "neo4j://localhost:7687",
  "transaction" : "http://localhost:7474/db/{databaseName}/tx",
  "bolt_direct" : "bolt://localhost:7687",
  "neo4j_version" : "4.3.6",
  "neo4j_edition" : "community"
}

Neo4j也清楚地出现在正在运行的进程列表中（以下是截断的输出）：

$ ps -U neo4j -u neo4j u
USER       PID %CPU %MEM    VSZ   RSS TTY      STAT START   TIME COMMAND
neo4j     1021  0.1  2.9 2202544 111492 ?      Ssl  16:21   0:05 /usr/bin/java -Xmx...
neo4j     1615  1.1 16.6 3269476 625720 ?      Sl   16:21   0:52 /usr/lib/jvm/java-...

要解决此问题，请首先创建缺少的运行目录，并将目录所有者设置为neo4j用户：

sudo mkdir /var/run/neo4j
sudo chown neo4j /var/run/neo4j

然后，通过发送中断（-2）信号停止neo4j的运行示例：

sudo kill -2 1021

再次检查ps，验证其是否正常工作：

$ ps -U neo4j -u neo4j u

启动进程，以neo4j用户身份运行它（同时，设置NEO4J_CONF shell变量指向neo4j.conf所在的目录）：

$ sudo -u neo4j env NEO4J_CONF=/etc/neo4j sh -c '/usr/share/neo4j/bin/neo4j start'

验证neo4j是否正在运行，检查活动进程（截断输出）：

$ ps -U neo4j -u neo4j u
USER       PID %CPU %MEM    VSZ   RSS TTY      STAT START   TIME COMMAND
neo4j     3803 14.9 15.5 3250848 587740 pts/0  Sl   17:47   0:22 /usr/lib/jvm/java-...

最后，验证status现在与实际情况正确一致：

$ /usr/share/neo4j/bin/neo4j status
Neo4j is running at pid 3803