官方的docs并没有对这些命令行工具说太多， 虽然你可以用-help来调用它们，但这只是描述了它们接受的其他选项。
然而，我可以告诉你在我的系统上发生了什么（macOS，其中Kotlin是使用HomeBrew安装的）。 我不知道下面的内容有多少适用于其他平台，但我怀疑至少Windows和Linux会非常相似。
这些可执行文件是 Package 器脚本，因此可以看到它们的一些功能。 （它们最终运行Kotlin程序，这限制了您所能看到的内容...） 
正在编译：
kotlinc-jvm是一个非常简单的 Package 器脚本，它仅仅调用kotlinc-因此它们之间显然没有任何有效的区别！
这表明Kotlin/JVM是默认的编译目标，至少在我的系统上是这样的。 （kotlinc-js也调用kotlinc，但只有在设置了$KOTLIN_COMPILER环境变量之后，这会改变kotlinc最终运行的程序。） 也许kotlinc在其他系统上有不同的默认值--或者至少他们希望允许这种可能性。
正在运行：
除了kotlin将Kotlin运行时类添加到类路径之外，运行kotlin的AIUI实际上等效于运行java。
当然，您可以在运行java时手动添加它们（例如，在$CLASSPATH或-cp参数中）;但是您需要知道它们在哪里，或者有某种方法找到它们。 （在我的系统中，它们在…/libexec/lib/中。 唯一重要的是相关的kotlin-stdlib jar，尽管有些代码也需要kotlin-reflect，也许其他代码也需要。 或者，如果您有完整的Kotlin安装，我认为您可以简单地添加kotlin-runner.jar，它会为您拉入其他代码。）
我不认为使用kotlin有任何其他好处。
请注意，如果您构建了一个‘fat’ .jar/.war文件，其中包含Kotlin运行库，那么大多数系统将使用java来运行该文件。