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如果我们将__init__.py设置为Text文件类型，Pycharm不会索引它。我们需要从Text文件类型

中删除__init__.py

我的问题是我在包名foo-bar中有一个连字符，这也带来了其他问题。foo_bar立即解决了这个问题。

对于谁挣扎与这个问题，我找到我的解决方案Pycharm 2018如下：
我们的想法是以-m的方式运行python代码，而不是

python -m module.a.b arguments

我们有

runpy.py module.a.b arguments

根据runpy documentation，它是
实现了-m命令行开关，该开关允许使用Python模块名称空间（而不是文件系统）定位脚本。
以下是我们实际执行的步骤：

• 找到位于系统内部的runpy.py。
• 按如下方式设置Pycharm配置：

在我的例子中，作为模块一部分的脚本是（即module.a.b）quickstart.cmd.genXML，脚本的参数是-p .。
这样，我们也可以像往常一样在pycharm内部对脚本调用python调试器。
参考编号：

• SO：在我的包的子包中运行python脚本
• Create a PyCharm configuration that runs a module a la “python -m foo”

这里的答案对我不起作用，但下面的答案对我起作用（Pycharm community 2018.3）：
1.从PyCharm分离项目
1.关闭PyCharm
1.从项目中删除.idea文件夹
1.启动PyCharm
1.重新打开项目并附加到当前窗口
1.突然项目被识别为包

最终为我解决了这个问题，因为init.py没有关联为文本文件，将按内容自动检测文件类型，这是在识别的文件类型列表的开头附近，并从列表中删除init.py。

如果高亮显示对__init__.py不起作用，这意味着PyCharm认为它是一个不同的类型，所以包将不起作用。
文件名模式可以在设置（File > Settings）中的Editor > File Types部分找到__init__.py可以在类别中，如Text或File type auto-detected by file content。您不需要搜索，只需将__init__.py放到Python类别中，一切都会恢复正常（在抱怨init文件已经在其他类别中之后）。
如果包含init文件目录没有适当的名称，则可能会出现其他问题。如果您坚持使用PEP8文件命名约定，则必须确保安全，但这些名称只是可接受文件名的子集。

您可以尝试将ProjectDirectory添加到路径中。为此，您必须转到：设置-〉项目设置-〉项目解释器，在那里你可以添加到路径按+。