是，通过使用可选的SYSTEM标志强制路径成为系统包含

include_directories(SYSTEM path)

https://cmake.org/cmake/help/latest/command/include_directories.html
从CMake 2.8.12开始，您可以使用新的target_include_directories在目标级别包含系统目录include，同时利用cmake的新使用要求特性：

target_include_directories(foo SYSTEM PUBLIC path)

现在目标foo将使用path作为一个系统包含，并且链接到foo的任何内容也将自动使用path作为一个系统包含。您可以通过将PUBLIC关键字更改为PRIVATE或INTERFACE来控制这些使用要求的传播。
https://cmake.org/cmake/help/latest/command/target_include_directories.html

如前所述，包含系统路径的正确方法是：

include_directories(SYSTEM path1 path2)

然而，在CMake 2.8.4和Makefiles中，这只用于C++而不是C，我研究了一下，GNU.cmake没有初始化：CMAKE_INCLUDE_SYSTEM_FLAG_C
因此，您可以在调用project()后立即自行设置此参数。

if(CMAKE_COMPILER_IS_GNUCC)
  set(CMAKE_INCLUDE_SYSTEM_FLAG_C "-isystem ")
endif()

更新：

CMake开发人员在2.8.5中修复了这个问题

您可以尝试使用CMAKE_C_FLAGS和CMAKE_CXX_FLAGS来添加其他标志。