VIM和VS代码都能识别文件是否使用了macOS/Unix行尾（LF，例如仅0a）或Windows文件行尾（CRLF，例如0d后接0a），并保留它们。您可以使用终端hexdump -C命令，查看您的行是否由0d0a或仅由0a分隔。
最有可能的情况是，在首次创建文件时，它们是使用Windows换行符序列保存的，而VIM和VS代码只是保留了该设置。

• 在VIM中，当你打开/保存文件时，如果文件当前使用的是Windows CRLF，你会在底部的状态消息中看到一个小的[dos]。如果它已经是Unix，你就不会在那里看到[dos]。

在VIM中，如果是[dos]文件，可以使用:set fileformat=unix将其转换为Unix行尾字符，然后保存转换后的文件。请参阅Vim convert file from DOS to UNIX。

• 在VS代码中，可以设置eol设置，但这只影响新文件。同样，现有文件将保留文件最初使用的行尾设置。

但是，如果你打开一个文件并查看状态栏，你会在右边看到一个LF或CRLF。你可以点击它来来回切换。

• 关于git端如何处理这个问题的信息，请参阅Configuring Git to handle line endings.我想你可能想坚持现有的行为（更新到Unix行尾字符），但是你会在GitHub文档中清楚地看到你的选项。但是如果你真的想把CRLF保留在你的文件中，你可以相应地配置你的repo。

根据您拥有的文件数量，您可能需要找到一个工具来将Windows/DOS行尾CRLF序列转换为Unix/macOS LF字符。快速的StackOverflow或网络搜索无疑会给予您很多建议。
或者，听起来你的repo已经更新为Unix风格的LF字符，所以你可能只想拉和使用它。