for /f %e in (file1) do findstr "%e" file2 >nul&if errorlevel 1 (echo %e>>missing) else (echo %e>>found)

作为提示符下的命令。如果作为批处理行运行，请将每个%e更改为%%e。
[未测试]

我不知道您的文件的结构，但我希望这个PowerShell脚本能有所帮助：

foreach($line in Get-Content .\Hosts.csv) {
    if(Get-Content .\Logs.csv | Select-String $line){
        echo "The host $line exists!"
    }
    else{
        echo "The host $line doesn't exist."
    }
}

其中“Hosts.csv”是主机列表，“Logs.csv”是一个文件，每行包含主机及其日志。