我是一名医学博士（所以完全没有计算机科学背景），开始参与大数据集的生物信息学分析，过去曾在我的私人Windows笔记本电脑上使用R，没有任何问题。
我的部门现在买了一台新的功能强大的笔记本电脑来加快分析速度，我们的生物信息学核心设备推荐使用Linux系统（我以前从来没有真正用过），所以现在我有了一台很棒的Ubuntu笔记本电脑，但我对刚刚设置好我的R环境开始工作感到有点沮丧。我听说Linux需要一些时间来适应，我我准备好迎接挑战，并想试着理解我在做什么。
所以我的问题是我不能真正在R中安装某些软件包。正如我所说，笔记本电脑是全新的，安装R和RStudio是我在没有改变笔记本电脑基本设置的情况下做的第一件事之一。所以我非常惊讶，我总是在安装这些软件包这样简单的事情上遇到错误。出于某种原因，一些软件包像

install.packages("tidyverse")

工作很好，而其他人失败。所以

install.packages("devtools")

提供以下输出

Installing package into ‘/home/jasper/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2’
(as ‘lib’ is unspecified)
also installing the dependencies ‘systemfonts’, ‘textshaping’, ‘ragg’, ‘pkgdown’

trying URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/systemfonts_1.0.4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 81757 bytes (79 KB)
==================================================
downloaded 79 KB

trying URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/textshaping_0.3.6.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 35722 bytes (34 KB)
==================================================
downloaded 34 KB

trying URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/ragg_1.2.4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 427579 bytes (417 KB)
==================================================
downloaded 417 KB

trying URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/pkgdown_2.0.7.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 871465 bytes (851 KB)
==================================================
downloaded 851 KB

trying URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/devtools_2.4.5.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 374718 bytes (365 KB)
==================================================
downloaded 365 KB

* installing *source* package ‘systemfonts’ ...
** package ‘systemfonts’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
Package fontconfig was not found in the pkg-config search path.
Perhaps you should add the directory containing `fontconfig.pc'
to the PKG_CONFIG_PATH environment variable
No package 'fontconfig' found
Package freetype2 was not found in the pkg-config search path.
Perhaps you should add the directory containing `freetype2.pc'
to the PKG_CONFIG_PATH environment variable
No package 'freetype2' found
Using PKG_CFLAGS=
Using PKG_LIBS=-lfontconfig -lfreetype
--------------------------- [ANTICONF] --------------------------------
Configuration failed to find the fontconfig freetype2 library. Try installing:
 * deb: libfontconfig1-dev (Debian, Ubuntu, etc)
 * rpm: fontconfig-devel (Fedora, EPEL)
 * csw: fontconfig_dev (Solaris)
 * brew: freetype (OSX)
If fontconfig freetype2 is already installed, check that 'pkg-config' is in your
PATH and PKG_CONFIG_PATH contains a fontconfig freetype2.pc file. If pkg-config
is unavailable you can set INCLUDE_DIR and LIB_DIR manually via:
R CMD INSTALL --configure-vars='INCLUDE_DIR=... LIB_DIR=...'
-------------------------- [ERROR MESSAGE] ---------------------------
<stdin>:1:10: fatal error: fontconfig/fontconfig.h: No such file or directory
compilation terminated.
--------------------------------------------------------------------
ERROR: configuration failed for package ‘systemfonts’
* removing ‘/home/jasper/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/systemfonts’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘systemfonts’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘systemfonts’ is not available for package ‘textshaping’
* removing ‘/home/jasper/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/textshaping’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘textshaping’ had non-zero exit status
ERROR: dependencies ‘systemfonts’, ‘textshaping’ are not available for package ‘ragg’
* removing ‘/home/jasper/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/ragg’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘ragg’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘ragg’ is not available for package ‘pkgdown’
* removing ‘/home/jasper/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/pkgdown’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘pkgdown’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘pkgdown’ is not available for package ‘devtools’
* removing ‘/home/jasper/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/devtools’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘devtools’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpZcPwU9/downloaded_packages’

在网上找了几天后，我相信有一个问题的目录或访问它们。当我进入

.libPaths()

在R中，它给了我
[1]“/home/碧玉/R/x86_64-pc Linux gnu库/4.2”“/usr/本地库/R/站点库”
[3]“/usr/lib/R/站点库”“/usr/lib/R/库”
所以我开始研究这个问题，并尝试修改这里描述的Renviron文件的R_LIBS_USER部分（How do I change the default library path for R packages），但没有任何成功。
当我尝试安装另一个软件包时，我收到了路径不可写的消息，我认为这可能是一个权限问题。所以我在.libPaths（）中显示的四个目录上使用了chmod -R 777（据我所知，它为我提供了这些文件夹的所有权限），但也没有成功。重复重新安装R和RStudio也没有帮助。
不幸的是，我的计算机科学技能很快就发现了自己的极限（老实说，甚至是在终端上工作）。由于我真的不知道我在做什么，而且想在更改这台新笔记本电脑根目录中的文件时这样做，我希望你能帮助我。退出并改回Windows不是我的自我选择：D。
下面是我的sessionInfo（）：
R版本4.2.2修补（2022年11月10日r83330）平台：x86_64-pc-linux-gnu（64位）运行环境：Ubuntu 20.04.5语言版本
基质产品：默认BLAS：文件/usr/lib/x86_64-Linux操作系统-gnu/blas/libblas.so.3.9.0软件包：/usr/文件库/x86_64-Linux操作系统-gnu/lapack
区域设置：[1] LC_CTYPE=美国英语。UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=德国英语。UTF-8 LC_COLLATE=美国英语。UTF-8 LC_MONETARY=德国英语。UTF-8
[6]LC_消息=中文.UTF-8 LC_纸张=中文.UTF-8 LC_名称=C LC_地址=C LC_电话=C
[11]LC_测量=去DE.UTF-8 LC_标识=C
随附基础 Package ：[1]统计数据图形grDevices实用程序数据集方法库
通过名称空间加载（且未附加）：[1]编译器_4.2.2快速Map_1.1.0 cli_3.4.1 html工具_0.5.4工具_4.2.2 rstudioapi_0.14 yaml_2.3.6 rmarkdown_2.19 [9]编译器_1.41 xfun_0.35摘要_0.6.31 rlang_1.0.6评估_0.19
我真的很感激你的帮助！
多谢了
碧玉