我无法在RStudio中获得MetaMDS对象的分数(包：素食者)

63lcw9qa 于 2022-12-20 发布在其他

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我正在RStudio中使用vegan 2.6.4，当我运行以下命令时，弹出了一条异常的错误消息：

nmds11 = metaMDS(m_com11, distance = "bray")
data.scores11 = as.data.frame(scores(nmds11)$sites)

Error in UseMethod("scores") : 
  no applicable method for 'scores' applied to an object of class "c('metaMDS', 'monoMDS')

我可以有把握地说，我从来没有遇到过这种情况，5分钟前我在不同的数据集上使用了完全相同的代码，没有出现任何问题。我以前也在至少12个其他矩阵上运行过相同的脚本，没有出现任何错误。
在查找scores函数时，我尝试按照建议调用scores.metaMDS（以帮助指定我试图从哪种类型的对象获取分数），但该函数显然不存在。我还尝试运行一些过去一直有效的旧脚本，结果也是同样的不幸。
你知道我能做些什么来解决这个问题吗？

来源：https://stackoverflow.com/questions/74737168/i-cannot-obtain-scores-for-a-metamds-object-in-rstudio-package-vegan

2条答案

按热度按时间

ni65a41a1#

尝试使用vegan::scores();可能是您加载的其他软件包也有一个scores()泛型，该泛型正在覆盖vegan::scores()。如果整个S3系统都已崩溃，您还可以尝试更具体的vegan:::scores.metaMDS()。
除此之外，重新启动R（在RStudio中，在菜单中找到Restart R选项），以便获得一个干净的会话，并尝试再次运行代码。

赞(0）回复(0）举报 2022-12-20

efzxgjgh2#

我试过Vegan：：：scores.metaMDS（）而没有重新启动RStudio，它很好用！谢谢！！！

赞(0）回复(0）举报 2022-12-20