如何根据R中出现的次数创建一个颜色编码的比较表？

k7fdbhmy 于 2022-12-30 发布在其他

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我比较了两个不同的评分员对850名患者的评分，评分可以是从1到9的整数。我的数据框由2列（两个评分员）和850行（每个患者一行，评分从1到9）组成。
使用table（）函数，我创建了一个表来比较两个评估者给出的值

table(df$score_assessor1, df$score_assessor2)

我在Excel中重新创建了该表：

我希望有相同的表，但有一个颜色代码的出现次数（例如白色如果= 0，黄色如果0〈x〈11，橙色如果11〈x〈30等...）
有人能帮我画出这样一张表吗？
先谢谢你。

来源：https://stackoverflow.com/questions/74941999/how-do-i-create-a-color-coded-comparison-table-based-on-the-number-of-occurrence

1条答案

按热度按时间

4ktjp1zp1#

您可以使用dplyr::count()和ggplot2创建一个简单的热图：

library(dplyr)
library(ggplot2)

df %>% 
  count(
    score_assessor1 = factor(score_assessor1, levels = 1:9), 
    score_assessor2 = factor(score_assessor2, levels = 1:9),
    .drop = FALSE
  ) %>% 
  ggplot(aes(score_assessor1, score_assessor2)) +
  geom_tile(aes(fill = n)) +
  geom_text(aes(label = n)) +
  scale_fill_distiller(palette = "YlOrRd", direction = 1) +
  coord_cartesian(expand = FALSE)

（转换为因子和count()中的.drop = FALSE使无计数的单元格显示为0，而不是NA。）

示例数据：*

library(scales)
set.seed(13)

df <- data.frame(score_assessor1 = rnorm(300)) %>% 
  mutate(
    score_assessor2 = score_assessor1 + rnorm(300) * 5,
    across(everything(), ~ round(rescale(.x, c(1, 9))))
  )

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