我最近也遇到了同样的问题，经过一段时间的研究（包括阅读源代码）我找到了一种方法。

1编程：

// for 0.2.x
{
  driver: PlatformTools.load('mysql2'),
  //...other options
}
// for 0.3.x
{
  connectorPackage: 'mysql2'
  //other options
}

2使用yml配置

在你的项目根目录下创建ormconfig.yml，在default.driver选项中放置一个空对象。

default:
  type: mysql #=TYPEORM_CONNECTION
  driver: {} #THIS'LL FORCE TO mysql2
  host: localhost #=TYPEORM_HOST
  port: 3306 #=TYPEORM_PORT
  username: xxxx #=TYPEORM_USERNAME
  password: xxxxx #=TYPEORM_PASSWORD
  database: xxx #=TYPEORM_DATABASE
  entities: #=TYPEORM_ENTITIES
    - dist/**/*.entity.js
  migrations: #=TYPEORM_MIGRATIONS
    - migration/*.js
  cli:
    migrationsDir: migration #=TYPEORM_MIGRATIONS_DIR

使用yml时，请确保路径中没有其他ormconfig.*。

在MysqlConnectionOptions有驱动程序对象，默认为require("mysql")，你可以设置为require("mysql2")。希望能帮助大家。