<Files index.php>
Allow from all
</Files>

请尝试以下操作：

<FilesMatch "^(index\.php)?$">
Allow from all
</FilesMatch>

• • 更新：**添加了遗漏的 * 锚点 *!

（尽管我假设您使用的是Apache 2.4，所以您应该使用相应的Require指令，而不是Order、Deny和Allow。）
或者，将所有现有指令替换为以下指令：

DirectoryIndex index.php

RewriteEngine On
RewriteRule !^(index\.php)?$ - [F]

这允许访问example.com/和example.com/index.php。要阻止对index.php的直接访问，请尝试以下操作：

RewriteRule ^[^/]+$ - [F]

mod_dir（即"目录索引"）在mod_rewrite之后处理。

RewriteRule ^$ index.php [L]

此规则是多余的，应由DirectoryIndex处理。

• • 更新日期：**

RewriteRule!^（index.php）？$-[F]工作，但我添加RewriteRule!^（index2.php）？$-[F]为第二个文件index2.php和它不工作...我得到403错误www.example.com/index2.php...我需要访问几个文件
通过添加另一个规则，它最终会阻止两个URL。因为一个或另一个规则总是成功的。
您可以在单个规则中使用regex * alternate *。例如：

RewriteRule !^(index\.php|index2\.php)?$ - [F]

同样的正则表达式也可以用在上面的<FilesMatch>容器中。
或者，如果您有许多此类异常，则具有多个 * conditions * 可能更易于阅读。例如：

RewriteCond %{REQUEST_URI} !=index.php
RewriteCond %{REQUEST_URI} !=index2.php
RewriteCond %{REQUEST_URI} !=index3.php
RewriteRule !^$ - [F]

但是请注意，和您原来的规则一样，这也会阻止"子目录"中的URL，而不仅仅是根目录。