尝试使用RegisterStartupScript代替。另外，附带说明，您的警报消息框中有一个打字错误。exits！= exists：）

ScriptManager.RegisterStartupScript(this, GetType(), "alertMessage", "alert('employee  Already Exists !.')", true);

不能在web方法内部使用register客户端脚本，因为没有往返和页面循环发生。
注册客户端脚本要求页面发布到服务器，然后运行代码，然后整个网页返回到客户端，重新加载，然后显示，然后运行注入的脚本。
然而，由于这是web方法，则意味着客户端js代码正在调用并运行web方法，因此这意味着客户端脚本可以启动/显示/具有/享受代码以启动/显示任何对话框或您想要在该客户端js代码中显示的任何内容。因此，使web方法返回一些“是文本”或您想要显示的任何内容，并将该代码写入客户端JS代码中，以随后基于web方法返回的内容显示正确的消息或对话框。
那么，要在网页中“注入”或“注册”一些js代码，这就要求网页已经发布到服务器上，这意味着网页的回发必须发生。
web方法不能更新网页上的控件，也不能注入js脚本，因为页面仍然位于用户的桌面上，从未访问过服务器。
然而，正如所提到的，由于您的js代码客户端将调用webmethod，那么让这样的js代码客户端根据webmethod的返回值显示消息应该是一件简单的事情。在您的情况下，如果要插入数据，则将“true”作为字符串返回，因此在register脚本的位置，返回“false”字符串，然后使调用JS代码基于返回给该调用JS代码的真或假来显示某些消息。