下面的代码在使用Xcode 12.2的Big Sur上运行。在 Catalina 10.15.7（19H15）上，我得到了与OP相同的错误消息。

./bootstrap.sh --with-libraries=regex,date_time 
./b2 architecture=combined cxxflags="-arch x86_64 -arch arm64"

我在Monterey使用M1（XCode 13.1），但没有得到任何其他答案，但我结合了Navan和Petr中的内容沿着其他一些位，使libboost_coroutine在x86_64上工作。我得到了以下脚本，它构建了所有boost库（为什么不呢，在M1上不需要很长时间）：

#!/bin/sh

rm -rf arm64 x86_64 universal stage bin.v2
rm -f b2 project-config*
./bootstrap.sh cxxflags="-arch x86_64 -arch arm64" cflags="-arch x86_64 -arch arm64" linkflags="-arch x86_64 -arch arm64"
./b2 toolset=clang-darwin target-os=darwin architecture=arm abi=aapcs cxxflags="-arch arm64" cflags="-arch arm64" linkflags="-arch arm64" -a
mkdir -p arm64 && cp stage/lib/*.dylib arm64
./b2 toolset=clang-darwin target-os=darwin architecture=x86 cxxflags="-arch x86_64" cflags="-arch x86_64" linkflags="-arch x86_64" abi=sysv binary-format=mach-o -a
mkdir x86_64 && cp stage/lib/*.dylib x86_64
mkdir universal
for dylib in arm64/*; do 
  lipo -create -arch arm64 $dylib -arch x86_64 x86_64/$(basename $dylib) -output universal/$(basename $dylib); 
done
for dylib in universal/*; do
  lipo $dylib -info;
done

这个脚本打印出universal目录下每个dylib的lipo信息，所以你可以很快看到每个dylib都包含了x86_64和arm64。我得到了下面的结果，也许它对你查看你的输出是否匹配很有用：

Architectures in the fat file: universal/libboost_atomic.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_chrono.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_container.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_context.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_contract.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_coroutine.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_date_time.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_filesystem.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_graph.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_iostreams.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_locale.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_log.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_log_setup.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_numpy27.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_prg_exec_monitor.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_program_options.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_python27.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_random.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_regex.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_serialization.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_stacktrace_addr2line.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_stacktrace_basic.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_stacktrace_noop.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_system.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_thread.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_timer.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_type_erasure.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_unit_test_framework.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_wave.dylib are: x86_64 arm64 
Architectures in the fat file: universal/libboost_wserialization.dylib are: x86_64 arm64

在这里花了相当多的时间后：
https://github.com/bfgroup/b2/issues/105
我可以在arm 64上编译boost，命令行是：
./b2体系结构=arm地址-型号=64 asmflags=--目标= arm 64-苹果-达尔文21.2.0 cflags=--目标= arm 64-苹果-达尔文21.2.0 cxxflags=--目标= arm 64-苹果-达尔文21.2.0链接标志=--目标= arm 64-苹果-达尔文21.2.0-s无LZMA=1 -s无ZSTD=1 abi=aapcs
LZMA和ZSTD标志在那里，因为我的机器上没有这些库的通用二进制文件。

我遇到了同样的问题，并遇到了这个answer，它是为i386和x86_64创建通用二进制文件。
要总结答案，您需要运行./b2两次（使用不同的工具集，因为clang总是为x86_64构建，即使您传递了适当的CXXFlags
这是我用来首先单独生成所需库，然后使用lipo组合它们的脚本

#!/bin/sh

rm -rf arm64 x86_64 universal
./bootstrap.sh --with-toolset=clang --with-libraries=thread,system,filesystem,program_options,serialization 
./b2  cxxflags="-arch arm64" toolset=darwin -a
mkdir -p arm64 && cp stage/lib/*.dylib arm64
./b2 toolset=clang cxxflags="-arch arm64 -arch x86_64" -a
mkdir x86_64 && cp stage/lib/*.dylib x86_64
mkdir universal
for dylib in arm64/*; do 
  lipo -create -arch arm64 $dylib -arch x86_64 x86_64/$(basename $dylib) -output universal/$(basename $dylib); 
done

你不需要使用lipo，你可以将-isysroot /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX.sdk传递给cxxflags，它将构建一个开箱即用的通用库。

我按照Navan Chauhan的答案，这似乎是在macOS 10.15.7和Xcode 12.3上进行的方式。
我唯一的问题是构建系统添加了额外的-arch armv4t clang选项（或类似的东西），这会导致构建失败。使用architecture=combine无法工作，因为它只能管理Intel和PowerPC。对我来说有效的是：

1. bootstrap.sh --with-toolset=clang-darwin和cxxflags、cflags和linkflags设置为-arch x86_64 -arch arm64以及其他选项。
2. x86_64内部版本：b2 toolset=clang-darwin target-os=darwin architecture=x86 stage和cxxflags、cflags和linkflags仅设置为-arch x86_64（以及其他选项）。
3. arm64构建版本：b2 toolset=clang-darwin target-os=darwin architecture=arm abi=aapcs stage和cxxflags、cflags和linkflags仅设置为-arch arm64（以及其他选项）。
   1.将库与lipo合并...
   我不得不将ABI也设置为 * 自动猜测-某事 * 无法识别Apple Silicon目标，因此一些汇编内容未编译-因此在构建过程中稍后会出现 * 缺失符号 *。最后，armv4t问题通过clang-darwin工具集解决。
   目前唯一需要注意的是，两个构建版本都进入了相同的体系结构/配置目录，这可以通过自定义user-config.jam或在每个stage之后立即调用install来解决，这就是我所做的。
   作品：

• 主机平台：英特尔
• macOS 10.15.7操作系统
• Xcode 12.3（已安装命令行工具）
• Boost 1.75.0（相关压缩和ICU库已编译为通用）

适用于带有M1 building boost 1.81.0的macOS

./bootstrap.sh
sudo ./b2  -address-model=64 architecture=arm+x86  install

同时安装支持这两种体系结构的库