你的问题是函数调用

fscanf(file, "%s\n", play)

并不符合你的意愿。
%s说明符将首先消耗并丢弃所有whitespace characters（包括空格和换行符），然后当它遇到非空白字符时，它将读取遇到的所有内容，直到下一个空白字符。
格式字符串中的\n字符将指示scanf使用并丢弃所有空格字符（而不仅仅是单个!），直到遇到非空格字符。
这意味着通过输入

F5
D6

C3

对fscanf的第一次调用将读取F5\n，对fscanf的第二次调用将读取D6\n\n，而第三次函数调用将读取C3\n。然而，这不是您想要的。您想要第二次调用仅读取一行而不是两行，即您想要它仅读取D6\n而不是D6\n\n。
我不建议你尝试用scanf来解决这个问题，相反，我建议你使用fgets，因为该函数的行为方式更直观，特别是，该函数总是一次读取一行（除非提供的内存缓冲区不够大，无法存储整行）。
下面是一个示例程序：

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>

#define MAX_MOVES 64

int main( void )
{
    char moves[MAX_MOVES][3];
    int num_moves = 0;

    FILE *fp;
    char line[4];

    //attempt to open file
    fp = fopen( "input.txt", "r" );
    if ( fp == NULL )
    {
        fprintf( stderr, "Error opening file!\n" );
        exit( EXIT_FAILURE );
    }

    //read moves from stream
    while ( fgets( line, sizeof line, fp ) != NULL )
    {
        //remove newline character, if it exists
        line[strcspn(line,"\n")] = '\0';

        //make sure that we have room for another move
        if ( num_moves == MAX_MOVES )
        {
            fprintf( stderr, "Error: Not enough room for storing more moves!\n" );
            exit( EXIT_FAILURE );
        }

        switch ( strlen( line ) )
        {
            case 0:
                //this is a skipped move
                strcpy( moves[num_moves++], "XX" );
                break;

            case 2:
                //this is not a skipped move
                if (
                    line[0] < 'A' || line[0] > 'H' ||
                    line[1] < '1' || line[1] > '8'
                )
                {
                    fprintf( stderr, "Error: Invalid move!\n" );
                    exit( EXIT_FAILURE );
                }
                strcpy( moves[num_moves++], line );
                break;

            default:
                fprintf( stderr, "Error: Move has invalid length!\n" );
                exit( EXIT_FAILURE );
        }
    }

    //print all moves
    for ( int i = 0; i < num_moves; i++ )
    {
        printf( "%s\n", moves[i] );
    }

    //cleanup
    fclose( fp );
}

对于输入

F5
D6

C3

该程序具有以下输出：

F5
D6
XX
C3