需要26 char的数组，而不是26 string的数组

// string key = argv[1], key2[26];
string key = argv[1];
char key2[26];

key2[]未初始化

不清楚OP要如何填充它。也许从下一个参数开始？

最好先测试argc

if (argc < 2) {
  fprintf(stderr, "Missing argument\n");
  return EXIT_FAILURE;
}
string key = argv[1];
...

丢弃不必要的1

// int main(int argc, string argv[1])
int main(int argc, string argv[])

这说明了为什么不应该将指针隐藏在typedef后面，以及为什么向程序员新手隐藏C的工作方式对任何人都没有好处。
C中没有string类型。这里的string只是char *的typedef。

string key = argv[1], key2[26];

为char *和char *的array[26]分配内存，它们不是同义词。
或者换句话说：它宣布：

char *key = argv[1];
char *key2[26];

注意，这些语句只为指针分配内存，而不是它们所指向的内容。在本例中，您确实初始化了key，但忘记初始化key2。
声明：

if (key[i] != key2[j])

因为key[i]的计算结果为char，而key2[j]的计算结果为char *（您没有为其分配内存，也没有对其进行初始化）。

修复：

只需将key2声明为char *，而不是char *的数组。
现在在复制之前找到argv[1]的长度（否则可能导致溢出）。

size_t len = strlen (argv[1]);

现在为key2分配内存：

char *key2 = malloc (len + 1); /* One for the '\0' byte */
if (!key2) {
    /* ENOMEM, handle error accordingly */
}

现在用strcpy()复制字符串并继续循环，完成后用free()清空内存。

• • 次要：**您在检查argv[1]是否有效之前正在访问它。

if (argc != 2) {
     fprintf (stderr, "/* Print usage message here */.\n");
     return EXIT_FAILURE;
 }