我也遇到过同样的问题，我是这样解决的：
首先转到终端中的Project目录

git init
git add .
git stash save
git branch --set-upstream-to=origin/master
git pull -r
git stash pop
git push

让我知道它是否工作

我遇到了同样的问题，因为我从GitHub网站添加了README.md文件，创建了另一个分支来添加它。Xcode不会自动提取通过网站所做的更改。
所以你必须进入Xcode菜单，选择源代码控制-〉拉取。

然后我选中了“将本地修改重定到上游修改上”，这会一次应用一个本地提交。我有很多提交没有推送，所以我选择了这个。

那警告是因为某人将已经push到你的repo之后这最后一次你从它拉出.你将需要到pull从这repo，合并你的代码并且然后你将能够到push再一次

我有这个问题，但我知道我肯定是最新的本地;一个人的团队，虽然我认为我在命令行中做的一些git更改会混淆Xcode。
最后似乎起作用的是下列因素的某种组合：
在Xcode中：
1.源代码管理-〉获取更改
1.源代码管理-〉拉取，带有rebase选项（如果你已经是最新的，应该什么都不会发生）
1.源代码管理-〉重置文件状态
1.退出Xcode（不要只是关闭项目，而是退出应用程序）
然后从项目文件夹根目录下的命令提示符处执行类似操作，但还要重置为origin/main（进行相应调整）：

(base) ➜  PROJECT git:(main) git fetch                                 
(base) ➜  PROJECT git:(main) git pull 
Already up to date.
(base) ➜  PROJECT git:(main) git reset --hard origin/main              
HEAD is now at 7a169f4 chore: still working through Xcode annoyance saying local repo is up to date.
(base) ➜  PROJECT git:(main) git pull                    
Already up to date.
(base) ➜  PROJECT git:(main) git fetch
(base) ➜  PROJECT git:(main)

然后回到Xcode，做一个虚拟的修改，提交并推送它。它对我很有效，警告现在消失了。
这是在Xcode 14.2，MacOS文图拉13.1。