R语言 多项式logistic回归后参数的最大似然估计[已关闭]

4bbkushb  于 2023-02-27  发布在  其他
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这是数据集,库(frair),数据=gammarus
我想估计参数p0、p1、p2和p3,公式为*NA/No= exp(P0+ P1*density+ P2*density^2+P3*density^3)/(1+exp(P0+P1*density+ P2*density^2+P3*density^3))*,其中Na是被捕食的猎物,No是被提供的猎物

vlju58qv

vlju58qv1#

设置

library(dplyr)
library(frair)

d <- gammarus %>% mutate(y = eaten/(eaten + alive))

步骤1:回归

您可以使用lm(线性模型)函数从方程

估计系数:

lm(y ~ density, data = d)

步骤2:多项式回归

要使用多项式函数形式,可以使用poly函数。第一个参数是变量,第二个参数是多项式的次数,然后必须指定是原始多项式还是正交多项式。在我们的示例中,它将是原始多项式,请查看this post以了解更多细节。
您可以通过将密度替换为密度的三次原始多项式来从

估计四个系数:

lm(y ~ poly(density, 3, raw = T), data = d)

第3步:逻辑回归

最后一步是从线性模型

转换到逻辑模型

,为此,您需要glm函数(广义线性模型),并且必须指定您需要family = binomial(link = "logit")的logit(而不是probit,例如this post)规格。

glm(y ~ poly(density, 3, raw = T), data = d, family = binomial(link = "logit"))

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