我有一个C扩展的项目,需要numpy。理想情况下,我希望下载我的项目的人能够运行python setup.py install
或使用一个pip
调用。我的问题是,在我的setup.py
中,我需要导入numpy来获得头文件的位置。但是我希望numpy只是install_requires
中的一个常规需求,这样它就会自动从Python包索引中下载。
下面是我尝试做的一个例子:
from setuptools import setup, Extension
import numpy as np
ext_modules = [Extension('vme', ['vme.c'], extra_link_args=['-lvme'],
include_dirs=[np.get_include()])]
setup(name='vme',
version='0.1',
description='Module for communicating over VME with CAEN digitizers.',
ext_modules=ext_modules,
install_requires=['numpy','pyzmq', 'Sphinx'])
显然,在安装之前我不能在顶部安装import numpy
,我看到过一个setup_requires
参数传递给setup()
,但是找不到任何关于它的文档。
这可能吗?
9条答案
按热度按时间xv8emn3q1#
下面的代码至少可以在numpy1.8和python{2.6,2.7,3.3}中使用:
对于一个小的解释,看看为什么它没有“黑客”失败,见this answer。
注意,使用
setup_requires
有一个微妙的缺点:numpy不仅在构建扩展之前会被编译,而且在执行python setup.py --help
时也会被编译,为了避免这种情况,你可以检查命令行选项,就像https://github.com/scipy/scipy/blob/master/setup.py#L205中建议的那样,但是另一方面,我真的不认为这是值得的。r8uurelv2#
我找到了一个非常简单的解决办法:
或者你可以坚持使用https://github.com/pypa/pip/issues/5761,这里你可以在实际安装之前使用setuptools.dist安装cython和numpy:
对我来说很有效!
dtcbnfnu3#
这是需要使用numpy的软件包的一个基本问题(对于distutils或get_include),我不知道有什么方法可以使用pip或easy-install来“引导”它。
然而,为你的模块制作一个conda包并提供依赖列表是很容易的,这样人们就可以执行一个conda install pkg-name来下载和安装所需的一切。
Conda有Anaconda和Miniconda两种版本(python +只是conda)。
查看此网站:http://docs.continuum.io/conda/index.html或此幻灯片组了解更多信息:https://speakerdeck.com/teoliphant/packaging-and-deployment-with-conda
368yc8dk4#
关键是将
numpy
的导入推迟到安装之后,我从这个pybind11 example学到的一个技巧是在一个helper类的__str__
方法中导入numpy
(下面是get_numpy_include
)。ev7lccsx5#
要使pip工作,可以执行与Scipy类似的操作:https://github.com/scipy/scipy/blob/master/setup.py#L205
也就是说,
egg_info
命令需要传递给标准的setuptools/distutils,但其他命令可以使用numpy.distutils
。dfddblmv6#
也许一个更实际的解决方案是只需要预先安装numpy,并在函数作用域中安装
import numpy
。@coldfix解决方案可以工作,但编译numpy要花很长时间。首先以wheels包的形式pip安装要快得多,特别是现在我们有了适用于大多数系统的wheels,这要归功于manylinux。nukf8bse7#
现在(2018年左右),这个问题应该可以通过在
pyproject.toml
中添加numpy作为 buildsystem dependency 来解决,这样pip install
就可以在运行setup.py
之前使numpy
可用。pyproject.toml
文件还应该指定您正在使用Setuptools来构建项目。有关详细信息,请参见Setuptools的Build System Support docs。
除了
install
之外,这里没有介绍setup.py
的其他用途,但是这些用途主要是为您(以及您项目的其他开发人员)准备的,所以一条错误消息说要安装numpy
可能会起作用。x6492ojm8#
如果Cython没有预先安装在目标机器上,则@coldfix的解决方案不适用于Cython扩展,因为它会失败并显示以下错误
错误:未知文件类型'.pyx'(来自'xxxxx/yyyyy. pyx')
失败的原因是过早导入
setuptools.command.build_ext
,因为导入时,它尝试使用Cython的build_ext
-功能:通常setuptools是成功的,因为导入发生在
setup_requirements
完成之后。但是,通过在setup.py
中导入它,只能使用回退解决方案,这对Cython一无所知。引导
Cython
和numpy的一种可能性是在间接/代理的帮助下推迟setuptools.command.build_ext
的导入:还有其他可能性,例如在SO-question中讨论。
cbeh67ev9#
你可以简单地将numpy添加到你的pyproject.toml文件中。