这些是我在一个df中的突变细节（染色体10：63661472 G〉C，染色体14：105246551 C〉T，染色体16：2225614 G〉T）我只想提取职位数，我想要这样的最终文件，63661472 105246551 2225614我该怎么做呢？谢谢
yb3bgrhw1#
有很多方法可以做到这一点。下面是extract的例子：
extract
library(tidyr) df %>% extract(cells, into = "numbers", regex = ".*:(\\d+).*", remove = FALSE) cells numbers 1 chr10:63661472 G>C 63661472 2 chr14:105246551 C>T 105246551 3 chr16:2225614 G>T 2225614
下面是一个使用str_extract和正后视的示例：
str_extract
library(stringr) df %>% mutate(numbers = str_extract(cells, "(?<=:)\\d+"))
下面是一个使用sub和反向引用的示例：
sub
df %>% mutate(numbers = sub(".*:(\\d+).*", "\\1", cells))
数据：
df <- data.frame( cells = c("chr10:63661472 G>C","chr14:105246551 C>T", "chr16:2225614 G>T") )
fd3cxomn2#
最简单的方法是使用以下代码：
numbers <- sub(".*:(\\d+).*", "\\1", df)
2条答案
按热度按时间yb3bgrhw1#
有很多方法可以做到这一点。
下面是
extract的例子：下面是一个使用
str_extract和正后视的示例：下面是一个使用
sub和反向引用的示例：数据：
fd3cxomn2#
最简单的方法是使用以下代码：