为什么R坚持要进口一根羽毛？

lzfw57am 于 2023-03-15 发布在其他

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我有一个R脚本，当我在一个循环中运行它时，它会在一个可变的迭代次数后保持不变。没有错误消息-只是挂起。
通过MRE：

library(arrow)

## clear environment
rm(list=ls())

### read in models
x <- 1
while (x < 50)
{
  print(x)
  matches_for_prediction <- read_feather(<file_path>)
  x = x + 1
  Sys.sleep(2)
}

我想知道这是否可能是某种打开文件的冲突，但我已经尝试延长睡眠无济于事。
坦白说......我主要使用Python，对R不太了解。

来源：https://stackoverflow.com/questions/66102268/why-is-r-sticking-on-importing-a-feather

2条答案

按热度按时间

kqhtkvqz1#

我也有这个问题，通过大量的挖掘，我发现这个问题：https://issues.apache.org/jira/browse/ARROW-11579它描述了在windows上有时会出现线程死锁。可能的解决方案如下：

允许通过arrow：：set_cpu_count（）使用减少线程数的箭头
通过选项切换多线程（arrow.use_threads = FALSE）
通过write_feather写入时不压缩文件（...，compression =“uncompressed”）

赞(0）回复(0）举报 2023-03-15

y1aodyip2#

由于代码可以在小文件上完美运行，因此可能是内存问题。
您可以尝试以下操作，这将给予：
1.你试图读取的文件的大小

R中新物体的大小
R使用的总内存（memory.size()仅适用于Windows）
1.执行垃圾收集，以便删除未使用的对象

x <- 1
while (x < 50) {
  print(paste('Reading file #',x,":",format(structure(file.size(path), class="object_size"),units='auto')))
  matches_for_prediction <- read_feather(path)
  print(paste('Object size',format(object.size(matches_for_prediction),'auto'),'- Total Memory used :',memory.size()))
  gc()
  x = x + 1
}

[1] "Reading file # 1 : 108.5 Mb"
[1] "Object size 669.9 Mb - Total Memory used : 1258.53"
...

循环只会在内存容量合适的情况下结束！

赞(0）回复(0）举报 2023-03-15

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