我想展示的是，不同物种的种子显示出不同的长度，这是由于物种的因素，对于每一个物种，我有几棵树，对于每一棵树，我有几颗测量过的种子。
我用R做了方差分析：

summary(aov(Length ~ Species))

然而，审阅者注意到了一个独立性的问题，因为种子可能从同一棵树提供。（而这确实是一个真实的的问题！）
为了回答这个问题，我想我应该做一个嵌套方差分析，对吗？
但是，有很多方法可以编写代码：

summary(aov(Length ~ Species*Tree))
summary(aov(Length ~ Tree*Species))
summary(aov(Length ~ Species/Tree))
summary(aov(Length ~ Species+Error(Tree)))

我相信这是列出的最后一种可能性，它将允许我表明种子的长度因物种而异，并考虑到种子可能来自同一棵树。
你能证实吗？
当我运行该命令时，我获得以下内容：

Error: Tree
Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)     
Species 12  320.6  26.715   14.98 4.96e-15 ***
Residuals  71  126.6   1.784                     
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 

Error: Within
Df Sum Sq  Mean Sq F value Pr(>F)
Residuals 1541  11.92 0.007733

这确实意味着物种对种子长度有显著的影响，对吗？
非常感谢你的帮助！！
穆里尔