我认为不需要根据您的情况设置顺序，您可以在MERGE语句中使用DENSE_RANK()解析函数，并带有MATCHED选项，假定id是主键，可以很容易地在子查询的匹配条件中使用，例如

MERGE INTO journals_cv027_tab j1 
     USING 
     (SELECT j.*, 
             DENSE_RANK() OVER (ORDER BY reference1) AS dr
        FROM journals_cv027_tab j) j2
          ON ( j2.id = j1.id )
      WHEN MATCHED THEN UPDATE SET j1.group_id = dr
     WHERE j1.group_id IS NULL

Demo
如果希望保留序号的值，则可以选择在截断表之前将group_id的最大值存储在具有一行和一列的表中，以便在下一次更新中作为<that value> + DENSE_RANK()...使用

可以使用临时表存储组的值：

create table group_journals_cv027_tab
as 
select reference1, 1 as group_id
from journals_cv027_tab 
group by reference1;

update group_journals_cv027_tab 
set group_id = JOURNALS_SEQ.nextval;

merge into journals_cv027_tab f1
using (select group_id, reference1 from group_journals_cv027_tab) s1
on (f1.reference1 = s1.reference1)
when matched then update set f1.group_id = s1.group_id
where f1.group_id is null;