在matplotlib、plotly和networkx中绘制重复的x轴范围

t8e9dugd 于 2023-03-19 发布在其他

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我需要画一个网络x图，x轴的范围是重复的，如0-100，0- 100，0 -100等。节点沿着这些x轴域分布，不同域之间的节点之间可以有连接的边。为了更容易理解，我分享了下面的图像，这是类似于我希望x轴是，但是使用matplotlib和/或plotly。Plotly更重要。我在dataframe列中用它们对应的域号12或13标记每个节点。

Node 1 | Node 2 | y axis | x1 | domain
1534   945             20    22803603   13
945    946             10    32494954   12
946    -               9     32530403   12

其中，边用Node 1-Node 2表示，其余列属于Node 1。最后一行不连接到其他节点。示例代码为

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
fig = plt.figure(figsize=(10,10))
ax = fig.add_subplot(111)
G = nx.DiGraph()
G.add_node(1534,pos=(22803603,20))
G.add_node(945,pos=(32494954,10))
G.add_node(946,pos=(32530403,9))
G.add_edge(1534,945)
G.add_edge(945,946)
pos=nx.get_node_attributes(G,'pos')
nx.draw_networkx(G,pos)
ax.tick_params(left=True, right=True, top=True, bottom=True, labelleft=True, labelbottom=True)

我按照这个例子，只是用上面的G替换了random graph：https://plotly.com/python/network-graphs/#color-node-points
这是一个示例图，我不关心节点的形状或边的曲率，我只关心x轴的格式。

matplotlib

来源：https://stackoverflow.com/questions/75455418/plotting-repeated-x-axis-ranges-in-matplotlib-plotly-and-networkx

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按热度按时间

omtl5h9j1#

我想你可以用下面的方法达到你想要的。它需要知道第二个（或更多）域什么时候开始。

定义图形并添加域索引（从0开始）

G = nx.DiGraph()
G.add_node(1534, pos=(22803603, 20), domain=0)
G.add_node(945, pos=(32494954, 10), domain=1)
G.add_node(946, pos=(32530403, 9), domain=1)
G.add_edge(1534, 945)
G.add_edge(945, 946)

定义域的起始X位置

d_starts = [0, 140_000_000]

获取节点相对于域的位置

positions = nx.get_node_attributes(G, "pos")
domains = nx.get_node_attributes(G, "domain")
final_positions = {}
for pos, dom in zip(positions.items(), domains.items()):
    label, (x, y) = pos
    _, d = dom
    final_positions[label] = [x + d_starts[d], y]

最后，用ticklabels和axvline在一个轴和“伪”2个轴上绘制图形

fig, ax = plt.subplots(figsize=(18,9))
nx.draw_networkx(G, final_positions, ax=ax)
# Works properly if d_starts values are modulo of the tick range step (here 10M)
max_xlim = int(ax.get_xlim()[1])
tick_range = range(0, max_xlim, 10_000_000)
labels = [f"{(i % d_starts[1]) / 1e6  :.0f}M" for i in tick_range]
ax.set_xlim(0, max_xlim)
ax.set_xticks(tick_range, labels , rotation=-45)
ax.tick_params(bottom=True, labelbottom=True)
for ypos in d_starts:
    ax.axvline(ypos, c="k")

把所有这些加在一起就是你得到的数字：

注意：如果需要，您可以轻松添加更多域。
对于你的标题，你需要一个域索引和域名之间的Map。

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