将R_markdown连接到PDF时loadnamespace出错

cqoc49vn 于 2023-03-27 发布在其他

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这是我第一次使用R_Markdown
我创建了一个新的R_Markdown，并试图将其编织成PDF。

processing file: R_markdown.Rmd
  |..........                                                            |  14%
  ordinary text without R code

  |....................                                                  |  29%
label: setup (with options) 
List of 1
 $ include: logi FALSE

  |..............................                                        |  43%
  ordinary text without R code

  |........................................                              |  57%
label: cars
  |..................................................                    |  71%
  ordinary text without R code

  |............................................................          |  86%
label: pressure (with options) 
List of 1
 $ echo: logi FALSE

  |......................................................................| 100%
  ordinary text without R code

output file: R_markdown.knit.md

"C:/Program Files/RStudio/bin/pandoc/pandoc" +RTS -K512m -RTS R_markdown.utf8.md --to latex --from markdown+autolink_bare_uris+tex_math_single_backslash --output R_markdown.tex --lua-filter "C:\Users\faiel\Documents\R\win-library\4.0\rmarkdown\rmarkdown\lua\pagebreak.lua" --lua-filter "C:\Users\faiel\Documents\R\win-library\4.0\rmarkdown\rmarkdown\lua\latex-div.lua" --self-contained --highlight-style tango --pdf-engine pdflatex --variable graphics --variable "geometry:margin=1in" 
Error in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]) : 
  namespace 'xfun' 0.17 is already loaded, but >= 0.19 is required
Calls: <Anonymous> ... namespaceImportFrom -> asNamespace -> loadNamespace
Execution halted

我不明白为什么会发生这种情况。我尝试了以下操作

install.packages("rmarkdown")

和

update.packages(ask = FALSE, checkBuilt = TRUE)
tinytex::tlmgr_update()

但如果运气不好

来源：https://stackoverflow.com/questions/64701557/error-in-loadnamespace-when-knitting-r-markdown-to-pdf

4条答案

按热度按时间

j2cgzkjk1#

loadNamespace（j〈- i1L，c（lib.loc，.libPaths（）），versionCheck = vIj）出错：命名空间*'xfun'*0.17已加载，但需要〉= 0.19

如果你发现了上面的错误，你可以使用下面的解决方案来删 debugging 误。同样的方法可以用于任何软件包。（代替xfun，任何软件包名称都可以出现）。

解决方案：

在RStudio中，导航到-〉Tools-〉Check For package updates，在这里您可以选择包并更新。如果这不起作用，请更新R版本并尝试更新包。
通过执行上述方法，软件包将被更新到较新的版本。

赞(0）回复(0）举报 2023-03-27

aor9mmx12#

CRAN上的xfun版本目前是0.18。显然，您正在使用需要xfun版本0.19的其他软件包。因此，您需要停止使用该非CRAN软件包，或从Github或其他未经测试的源代码更新xfun。
你可以运行remotes::update_packages()来搜索很多地方的更新。我不建议依赖非CRAN包：它们明天可能会以不相容的方式改变。
要找出remotes包（或devtools）安装了哪些非CRAN包，可以运行

subset(as.data.frame(installed.packages(fields="RemoteType")), !is.na(RemoteType))

但是，我不认为它会检测到通过下载.tar.gz或.zip文件安装的软件包。我不知道如何检测这些软件包。

赞(0）回复(0）举报 2023-03-27

ryevplcw3#

我在RStudio 1.4.1103.0和R 4.0.4（Win10，20H2）下也遇到过同样的问题。这个问题是在我更新了安装的软件包后出现的。我不能确切地说是哪个，因为我更新了所有的软件包。

Error in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]) : namespace 'xfun' 0.17 is already loaded, but >= 0.19 is required

Xfun无法更新，我卸载了rstudio，然后分别安装了最新版本的RStudio（11.04.）和R（4.0.5.），之后我可以再次更新xfun（0.22），问题解决。
总而言之，这很费时间，而且我不太明白这个问题。也许有更好的方法？

赞(0）回复(0）举报 2023-03-27

d8tt03nd4#

来自Ranjan Shetty works的回答. https://stackoverflow.com/users/15898034/ranjan-shetty
只是重新安装xfun包，问题解决了.
（我没有评论，因为我没有足够的积分）

赞(0）回复(0）举报 2023-03-27