您需要使用所需的参数创建和调优自己的lexer（文档）。
类似这样的东西（抱歉，未测试）：

begin
  ctx_ddl.create_preference('comma_lexer', 'BASIC_LEXER');
  ctx_ddl.set_attribute('comma_lexer', 'PRINTJOINS', '''()/^&"');
  ctx_ddl.set_attribute('comma_lexer', 'PUNCTUATIONS', ',.-?!');
end;
/

create index node_sequence_index 
  on testtable(node_sequence)
  indextype is ctxsys.context 
  parameters ('lexer comma_lexer')
;

更新

代码来自@Chandan的评论，适用于问题中提到的条件：

begin 
  ctx_ddl.create_preference('comma_lexer', 'BASIC_LEXER');
  ctx_ddl.set_attribute('comma_lexer', 'WHITESPACE', ',');
  ctx_ddl.set_attribute('comma_lexer', 'NUMGROUP', '#'); 
end; 
/

create index node_sequence_index 
  on testtable(node_sequence) 
  indextype is ctxsys.context 
  parameters ('lexer comma_lexer')
;

begin 
  ctx_ddl.create_preference('IDX_search', 'BASIC_LEXER');
  ctx_ddl.set_attribute('IDX_search', 'startjoins', ',');
end; 

CREATE INDEX FGK.IDX_CALC_UIDS_search 
  ON tbl_HISTORY (search) indextype 
  is ctxsys.context parameters('lexer IDX_search sync(on commit)');