听起来你可能遇到了任务关联问题。这可能会导致Android以不同的风格启动应用的多个示例。
默认情况下，Android会根据应用的包名称（即应用ID）为应用的每个示例分配一个唯一的任务ID。此任务ID用于管理应用在最近应用列表中的状态，因此，如果应用的多个示例具有相同的任务ID，则它们可能会在最近应用列表中分组在一起。
要避免此问题，您可以通过将taskAffinity属性添加到每个风格的AndroidManifest.xml文件中，为应用的每个风格设置唯一的任务关联性。
例如：

<manifest xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android"
    package="com.example.myapp">

    <!-- ... -->

    <application
        android:name="io.flutter.app.FlutterApplication"
        android:label="MyApp"
        android:icon="@mipmap/ic_launcher">
        
        <!-- ... -->
        
        <!-- set a unique task affinity for this flavor -->
        <activity
            android:name=".MainActivity"
            android:label="MyApp"
            android:configChanges="orientation|keyboardHidden|keyboard|screenSize|locale"
            android:theme="@style/LaunchTheme"
            android:launchMode="singleTop"
            android:taskAffinity="com.example.myapp.flavor1">
            <intent-filter>
                <action android:name="android.intent.action.MAIN"/>
                <category android:name="android.intent.category.LAUNCHER"/>
            </intent-filter>
        </activity>
        
        <!-- ... -->

    </application>
</manifest>

在上面的示例中，MainActivity Activity的 taskAffinity 属性设置为 com.example.myapp.flavor1，该Activity是应用的主入口点。您需要为应用的每个风格设置唯一的任务关联，并为每个风格使用不同的值。
通过为每种风格设置唯一的任务关联性，您应该能够确保应用的每种风格在最近使用的应用列表中作为单独的任务启动，并且不会自动将它们分组在一起。