v1.9.8+（released November 2016）

From ?unique.data.table默认情况下使用所有列（与?unique.data.frame一致）

unique(dt)
   V1 V2
1:  A  B
2:  A  C
3:  A  D
4:  B  A
5:  C  D
6:  E  F
7:  G  G

或者使用by参数来获得特定列的唯一组合（就像以前使用的键一样）。

unique(dt, by = "V2")
   V1 V2
1:  A  B
2:  A  C
3:  A  D
4:  B  A
5:  E  F
6:  G  G

1.9.8之前版本

从?unique.data.table中可以清楚地看到，对数据表调用unique只对键有效。这意味着您必须在调用unique之前重置所有列的键。

library(data.table)
dt <- data.table(
  V1=LETTERS[c(1,1,1,1,2,3,3,5,7,1)],
  V2=LETTERS[c(2,3,4,2,1,4,4,6,7,2)]
)

使用一列作为键调用unique：

setkey(dt, "V2")
unique(dt)
     V1 V2
[1,]  B  A
[2,]  A  B
[3,]  A  C
[4,]  A  D
[5,]  E  F
[6,]  G  G

使用您的示例data. table...

> dt<-data.table(V1 = c("B", "A", "A", "A", "A", "A", "C", "C", "E", "G"), V2 = c("A", "B", "B", "B", "C", "D", "D", "D", "F", "G"))
> setkey(dt,V2)

考虑以下测试：

> haskey(dt) # obviously dt has a key, since we just set it
[1] TRUE

> haskey(dt[,list(V1,V2)]) # ... but this is treated like a "new" table, and does not have a key
[1] FALSE

> haskey(dt[,.SD]) # note that this still has a key
[1] TRUE

因此，您可以列出表中的列，然后获取其中的unique()，而不需要根据@Andrie的解决方案（由@MatthewDowle编辑）的要求将键设置为所有列或删除它（通过将其设置为NULL）。@Pop和@Rahul提出的解决方案对我不起作用。
请参阅下面的第3次尝试，这与您最初的尝试非常相似。你的例子不清楚，所以我不知道为什么它不起作用。另外，几个月前你发布了这个问题，所以也许data.table已经更新了？

> unique(dt) # Try 1: wrong answer (missing V1=C and V2=D)
   V1 V2
1:  B  A
2:  A  B
3:  A  C
4:  A  D
5:  E  F
6:  G  G

> dt[!duplicated(dt)] # Try 2: wrong answer (missing V1=C and V2=D)
   V1 V2
1:  B  A
2:  A  B
3:  A  C
4:  A  D
5:  E  F
6:  G  G

> unique(dt[,list(V1,V2)]) # Try 3: correct answer; does not require modifying key
   V1 V2
1:  B  A
2:  A  B
3:  A  C
4:  A  D
5:  C  D
6:  E  F
7:  G  G

> setkey(dt,NULL)
> unique(dt) # Try 4: correct answer; requires key to be removed
   V1 V2
1:  B  A
2:  A  B
3:  A  C
4:  A  D
5:  C  D
6:  E  F
7:  G  G

unique(df)可以在您的示例中工作。

这个应该对你有用

dt <- unique(dt, by = c('V1', 'V2'))

保存数据。可以使用的表格表示法：

unique(df[, .(V1, V2, V3), nomatch=0 ])

如https://stackoverflow.com/a/31875208/10087503
我还没有比较这个与岩浆的版本的速度。