.*将找到匹配，而不管是否贪婪，因为在该行的末尾，没有随后的is here（自然地）。
解决这个问题的一个方法是使用lookbehind（从行尾检查，如果过去的几个字符与is here匹配）。
^Hi there (.*)(?<! is here)$

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正如Alan Moore所建议的，进一步将模式更改为^Hi there (.*$)(?<! is here)将提高模式的性能，因为捕获组将在尝试向后查找之前吞噬字符串的其余部分，从而节省了不必要的回溯。

从您的示例中还不完全清楚您是否希望防止“is here”在任何地方出现或仅在行尾出现。如果它不应该发生在任何地方，请尝试以下操作：

^Hi there ((?! is here).)*$

在每个字符之前，它检查下一个字符是否不是“is here”。
或者，如果你只想在它出现在一行的最后时排除它，你可以像Thorbear建议的那样使用负向后看：

^Hi there (.*)(?<! is here)$

您完全正确地解释了为什么您的表达式与所有输入行匹配。.*匹配了所有内容，并且(?! is here)$的预测总是为真，因为“is here”永远不会在行尾之后出现（因为那里什么都没有）。

你不需要用正则表达式来解决你的问题，你只需要使用正则表达式来找出非预期的正则表达式是否匹配。当然，如果你已经知道这一点，只是想了解一下lookaheads/lookbehinds，你可以放弃这个答案的其余部分。
如果你使用你不希望输入字符串匹配的正则表达式：

badregex = (Hi there (.*)(is here))

这将给予你一个匹配

Hi there, John is here

因此，您可以将逻辑放在应用程序级别，它应该在的地方（regex中的逻辑是一件糟糕的事情）。一点伪代码（我现在可以写出Java，但你已经明白了）

if (badregex.exactMatch(your_str))
   discardString();
   return;
if (goodregex.exactMatch(your_str))
   doStuff(your_str);