我一直在尝试使用conda设置我的R（最终与Beaker Notebook一起使用），我希望能够在我的conda安装的R版本中使用RStudio。
安装R的方法：
conda install -c r r
conda install -c r r-essentials
conda install -c r r-rserve
conda install -c r r-devtools
conda install -c r r-rcurl
conda install -c r r-RJSONIO
conda install -c r r-jpeg
conda install -c r r-png
conda install -c r r-roxygen2
conda install --channel https://conda.anaconda.org/bioconda bioconductor-edger我运行了那个版本的R（我只安装了这个版本）
> version
_
platform x86_64-apple-darwin11.0.0
arch x86_64
os darwin11.0.0
system x86_64, darwin11.0.0
status
major 3
minor 3.1
year 2016
month 06
day 21
svn rev 70800
language R
version.string R version 3.3.1 (2016-06-21)
nickname Bug in Your Hair在Jupyter中运行R是一种错误。例如，当它输出错误时，它输出到stdout，并使用换行符拆分字符串中的每个字符。我想使用RStudio，但我不想安装另一个版本的R。
如何将conda版本的R路由到RStudio？
下面是我的.bash_profile不确定这是否有用：
$ cat ~/.bash_profile
# added by Anaconda3 4.0.0 installer
export PATH="/Users/jespinoz/anaconda/bin:$PATH"
export RSTUDIO_WHICH_R=/Users/jespinoz/anaconda/bin/R我一直在努力学习这些教程，但我迷路了。我真的不太熟悉环境变量之类的东西。
(1)https://support.rstudio.com/hc/en-us/community/posts/207830688-Using-RStudio-with-conda
(2)Launch mac eclipse with environment variables set
当我寻找我的R时，它指示我：
$ which R
/Users/jespinoz/anaconda/bin/R但是从（1）开始的方向使用了这条非常令人困惑的路径：
/Users/jespinoz/anaconda/lib/R/bin/R我试着做这个家伙做了什么，并添加到我的.bash_profile，但它没有工作。我甚至做了一个.bashrc，但它仍然没有工作（我sourced后，我添加了行）export RSTUDIO_WHICH_R=/Users/jespinoz/anaconda/bin/R
How to tell RStudio to use R version from Anaconda
遗憾的是，anaconda在https://docs.continuum.io/anaconda/ide_integration中没有这方面的教程
8条答案
按热度按时间jvlzgdj91#
参见https://anaconda.org/r/rstudio：
然后从命令行：
(It是我如何安装它和它的工作。）
0pizxfdo2#
只要
which R显示一个工作的R解释器（如果你已经从conda安装了r包并激活了你的环境，它应该会这样做），然后从同一个环境启动rstudio* 应该会很好地选择它。为了测试，在
ArchLinux上，我构建并安装了：https://aur.archlinux.org/packages/rstudio-desktop-git/..然后强制删除R解释器（
pacman -Rdd r），然后从conda（conda install -c r r）安装r，它工作正常。然后我关闭了我的终端并打开了一个新的终端（这样正确的conda环境 * 就不会 * 被激活），并使用以下命令成功启动了RStudio：RSTUDIO_WHICH_R=/home/ray/r_3_3_1-x64-3.5/bin/R rstudio我认为关键是从正确的环境中启动
RStudio？您的~/.bash_profile和~/.bashrc仅在运行bash时才被源化。对于要设置的环境变量，以便桌面环境知道它们，在Linux上，您应该将它们放在~/.profile中，或者放在/etc/pam.d中（在进行这些更改后，您可能需要注销或关闭），在OS X上，您应该检查https://apple.stackexchange.com/q/57385kknvjkwl3#
更新：将此添加到
~/.bash_profile！最后一行署名@Z-Shiyi https://github.com/conda/conda/issues/3316#issuecomment-241246755
除了@Ray Donnelly上面说的。基本上，它必须从正确的环境中执行（即从终端运行它）。
您可以：
(A)把它放在你的
~/.bash_profileexport RSTUDIO_WHICH_R=/Users/[yourusername]/anaconda/bin/R中（如果你使用conda，但你可以把任何R路径）(B)然后在它被源化后在终端中键入以下内容（要么重新启动终端，要么执行
source .bash_profile）：open -a RStudio应该可以。或者你可以做我做的：
(A)打开automator（如果你没有在Mac上，请抱歉;这将只适用于Mac）
(B)使用
Run Shell Script(C)然后删除已经存在的
cat并放入：export RSTUDIO_WHICH_R=/Users/[yourusername]/anaconda/bin/R open -a RStudio(D)将其保存为类似
run_rstudio.app的文件，然后运行它，它应该可以工作：tuwxkamq4#
从已激活的Conda环境中启动RStudio
至少对于MacOSX，我发现在shell会话中激活环境，然后启动RStudio就足够了。
一旦进入R，就可以验证
R.home()和.libPaths()的值指向特定于环境的位置。这里的优点是，您不必固定使用环境变量中最后设置的任何内容，例如，通过
.bash_profile。相反，可以有许多基于R的环境，并在它们之间切换（或同时运行多个环境），而无需篡改全局设置。建议使用别名方便
也许我建议的唯一全局设置是将
rstudio的别名添加到.bash_profile，这样就不必每次都键入完整路径，如这使得一个人能够
其中
&允许用户继续使用shell或关闭它，而不会影响RStudio示例。ep6jt1vc5#
更新：Anaconda发行版现在有RStudio的软件包，所以你应该能够使用它，而不必跳过任何环节。您也可以直接安装Anaconda Navigator。
wi3ka0sx6#
做一个软链接对我来说很有用：
7kjnsjlb7#
现在conda forge repo中有一个RStudio版本，可以用来安装更新版本的RStudio（如
2022.12.0）。请注意，当您创建R conda环境时，重要的是您要only use packages from the same channel，并且不要混合使用例如。conda-forge与默认通道（这可能会导致错误，如
unable to load shared object '/home/joel/miniconda3/envs/r/lib/R/library/ragg/libs/ragg.so'（也经常发生与stringi））。确保不会发生通道混合的一种方法是使用-c指定通道，并使用--override-channels来防止搜索默认通道：q1qsirdb8#
如果（现在）有什么好的...
conda具有rstudioapi包，它将Rstudio带到您的本地环境中，并获取活动环境中安装的本地/默认r-base。您可以通过键入以下内容来安装它（一旦您的环境 * 激活 *）：
然后你只需要输入（在你的环境中）：rstudio