library(WGCNA)loadNamespace中的错误

cczfrluj  于 2023-05-20  发布在  其他
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我从头开始重新安装RSTUDIO & R。
What package is "訴mpute"? it is not compute.es
另外,如果有人知道如何摆脱汉字/汉字,请让我知道;已经删除了所有其他语言,只留下英语和重新启动。
也许3.0.3没有“归因”?
Warning in install.packages : package 訴mpute·is not available (for R version 3.0.3)
谢谢

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(R) library(WGCNA) Error in loadNamespace(j <- i1L, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vIj) : there is no package called 訴mpute·Error: package or namespace load failed for 糎GCNA· (R) sessionInfo() R version 3.0.3 (2014-03-06) Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
locale:[1] LC_COLLATE=英语_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252
[3]LC_MONETARY=英语_United States.1252 LC_NUMERIC=C
[5]LC_TIME=英语_美国.1252
附加的基本 Package :[1]平行样条网格数据集grDevices stats graphics tcltk utils
[10]方法库
其他附加包:[1] compute.es_0.2-3 mlbench_2.1-1 random GLM_1.02 -1 doParallel_1.0.8
[5]迭代器_1.0.6 MASS_7.3-29 Hmisc_3.14-3公式_1.1 -1
[9]survival_2.37-7 lattice_0.20-27 flashClust_1.01-2 dynamicTreeCut_1.60-1 [13] RODBC_1.3-10 ada_2.0-3 rpart_4.1-5 foreach_1.4.1
[17]stringr_0.6.2 debug_1.3.1 snow_0.3-13 ROCR_1.0-5
[21]gplots_2.12.1 rattle_3.0.2 RSNNS_0.4-4 Rcpp_0.11.1
通过命名空间加载(并且未附加):[1] bitops_1.0-6 caTools_1.16 cluster_1.14.4 codetools_0.2-8
[5]编译器_3.0.3 gdata_2.13.2 gtools_3.3.1 KernSmooth_2.23-10 [9] latticeExtra_0.6-26 matrixStats_0.8.14 mvbutils_2.7.4.1 R.methodsS3_1.6.1
[13]RColorBrewer_1.0-5工具_3.0.3

nue99wik

nue99wik1#

来自:http://labs.genetics.ucla.edu/horvath/CoexpressionNetwork/Rpackages/WGCNA/

install.packages(c(“dynamicTreeCut”,“cluster”,“flashClust”,“Hmisc”,“reshape”,“foreach”,“doParallel”))source(“http://bioconductor.org/biocLite.R“)biocLite(“impute”)

(R)库(WGCNA)

    • 已加载软件包WGCNA 1.34。* * 重要提示:您的系统似乎支持多线程,* 但在R的WGCNA中没有启用。* 若要在WGCNA中允许所有可用内核的多线程,请在R中使用 * * allowWGCNAThreads()* 。如有必要,请使用disableWGCNAThreads()禁用线程。 或者,在系统上设置以下环境变量:* * ALLOW_WGCNA_THREADS= * * 例如 * * ALLOW_WGCNA_THREADS=4 * * 要在linux bash shell中设置环境变量,请在运行R之前键入 * * export ALLOW_WGCNA_THREADS=4 * *。其他的操作系统或shell也会有类似的命令来达到同样的目的。

Attaching package: 糎GCNA· The following object is masked from 叢ackage:stats·

cor
qmb5sa22

qmb5sa222#

我也面临同样的问题我通过这个解决了
install.packages(c(“matrixStats”,“Hmisc”,“splines”,“foreach”,“doParallel”,“fastcluster”,“dynamicTreeCut”,“survival”,“BiocManager”))BiocManager::install(c(“GO.db”,“preprocessCore”,“impute”));

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