1. $match阶段
2. $group-按filter_id分组。此阶段之后的输出将不再有filter_id字段，您应该参考_id。而要获得category，您可以考虑使用$first运算符。
3. $lookup-使用_id作为localField。连接集合应该是 filter_options_weights，而不是 filter_values_weights。并以filter_option_value的形式返回联接的集合结果。
4. $set-通过$map将filter_option_value字段转换为新数组来设置filter_option_value字段，并使用key设置每个文档：filter_option_value和值：counter。

db.filter_weights.aggregate([
  /* $match stage, */
  {
    $group: {
      _id: "$filter_id",
      category: {
        $first: "$category"
      },
      counter: {
        $sum: "$counter"
      }
    }
  },
  {
    $lookup: {
      from: "filter_options_weights",
      localField: "_id",
      foreignField: "filter_id",
      as: "filter_option_value"
    }
  },
  {
    $set: {
      filter_option_value: {
        $map: {
          input: "$filter_option_value",
          in: {
            $arrayToObject: [
              [
                {
                  k: "$$this.filter_option_value",
                  v: "$$this.counter"
                }
              ]
            ]
          }
        }
      }
    }
  }
])

Demo @ Mongo Playground