要生成可由MATLAB运行的代码，您需要MATLAB Coder。codegen命令将生成可在MATLAB中运行的可执行文件。MathWorks的Loren在产品上有一个nice blog post。
Here is an example of how to use codegen从MATLAB代码创建MEX函数。
一个很大的警告是，使用MATLAB Coder，MATLAB的完整功能还不能用于编译。这是因为生成的二进制文件不需要MATLAB编译器运行时（MCR），它本质上是一个无头的MATLAB虚拟机。相反，MATLAB Coder生成真正独立的C代码，但代码生成因此受到一定限制。功能子集的Here is a description和here are complete lists of functions supported。根据categorical list，大多数工具包函数似乎都得到了支持。
如果所需的函数不受支持，则有必要使用编译器生成独立的库，并将您自己的MEX接口滚动到这些库，正如MrAzzaman所指出的。另一种可能性是使用loadlibrary函数直接加载编译器生成的库，尽管我从未尝试过最后一种选择。如果你不能在MATLAB中成功地与这些库接口，MATLAB编译器当然可以用来生成一个独立的可执行文件。deploytool简化了打包代码及其依赖项的过程。

MATLAB Compiler听起来正是你所需要的。不幸的是，它是一个单独的工具箱，你将不得不购买。
编辑：我应该注意到，这将编译您的MATLAB代码到一个应用程序/库，* 不是 * MATLAB代码。我相信其他团队仍然可以在MATLAB中使用它，但我不认为他们能够看到代码本身。

披露：我为MathWorks工作，并为以下资源做出了贡献：
你可能会发现MathWorks的这个指南很有帮助：GitHub上的“MATLAB工具箱开发的最佳实践”。这是在一个许可证下，以便人们可以自由地重新分发它，并将其纳入自己组织的最佳实践。
以下是您将在指南中找到的一些关键建议：

• 要交付给最终用户的所有内容都放在一个名为“工具箱”的文件夹中。
• 帮助创作团队协作的所有内容，如README.md和构建实用程序都位于源代码存储库的根目录中。
• 通过工具箱文件夹中的“示例”文件夹中的示例进行文档
• 打包并发布您的工具箱，以便与其他人共享，这样您就可以了解用户的版本。使用语义版本控制。
• 考虑使用参数验证、命名空间、MATLAB应用程序和实时任务来提高代码质量和生产力。
• 通过单元测试、MATLAB项目和新的构建工具使您的工具箱更加强大。

我们还包含了实现所有最佳实践的a complete example。
https://github.com/mathworks/toolboxdesign