（我不确定你希望结果是什么样的，但这里是你如何将A从B中平移出来，使得A1和B0正好是6个单位，并且它们的方向保持不变。
我喜欢用numpy来解决很多数值线性代数问题：

import numpy as np

# A and B have row vectors which are the positions of the points.
A=np.array([[-3.046233, -5.4e-05, 0.182027], [-2.084295, 5.1e-05, 0.033334], [-3.450141, 0.000367, -0.693385]])
B=np.array([[2.911769, 4.4e-05, -0.165016], [3.305155, 0.771695, 0.262288], [3.305, -0.772028, 0.261672]])

# The length of A1->B0 is 4.99 as you've mentioned:
A1B0_length = np.linalg.norm((A[1]-B[0]))

# Taking the unit direction vector B[0] -> A[1] by normalizing
drx_vec = A[1] - B[0]
drx_vec = drx_vec / np.linalg.norm(drx_vec)

# Choose the final length you want B[0]->A[1], then translate everything:
# Here I use 6 as an example,
translate_vec = drx_vec * 6
A_new = A + translate_vec

这将沿着A1B[0]轴移动A中的所有点，使它们之间的距离为6。如果你想改变方向，你可以平移A，使枢轴点在原点，转置A，使位置是A^T的列，然后乘以左边的旋转矩阵（见旋转矩阵），转置它，然后将它平移回原来的位置。