我想用gtsummary创建这里显示的表格,你能告诉我吗?table
i7uaboj41#
您可以通过传递给add_difference()的自定义函数添加比值比。有关如何构造自定义函数的说明请参见https://www.danieldsjoberg.com/gtsummary/reference/tests.html#custom-functions-1。我在下面写了一个例子。但是请仔细注意fisher.test()是如何从2x2表中构造比值比的。您可能需要切换table()中变量的顺序,甚至颠倒变量水平的顺序,以获得所需的比值比。
add_difference()
fisher.test()
table()
library(gtsummary) packageVersion("gtsummary") #> [1] '1.6.0' # function to calculate OR from 2x2 table or_fun <- function(data, variable, by, ...) { table(data[[by]], data[[variable]]) %>% fisher.test() %>% broom::tidy() } # testing function or_fun(trial, "trt", "response") #> # A tibble: 1 × 6 #> estimate p.value conf.low conf.high method alternative #> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <chr> <chr> #> 1 1.21 0.540 0.633 2.34 Fisher's Exact Test for Count… two.sided # add OR to a `tbl_summary()` tbl <- trial %>% select(response, trt) %>% tbl_summary(by = trt, missing = "no", statistic = all_categorical() ~ "{n} / {N} ({p}%)") %>% add_difference(test = response ~ or_fun, estimate_fun = response ~ style_ratio) %>% modify_header(estimate ~ "**Odds Ratio**")
x1c 0d1x由reprex package(v2.0.1)于2022-05-08创建
1条答案
按热度按时间i7uaboj41#
您可以通过传递给
add_difference()
的自定义函数添加比值比。有关如何构造自定义函数的说明请参见https://www.danieldsjoberg.com/gtsummary/reference/tests.html#custom-functions-1。我在下面写了一个例子。但是请仔细注意
fisher.test()
是如何从2x2表中构造比值比的。您可能需要切换table()
中变量的顺序,甚至颠倒变量水平的顺序,以获得所需的比值比。x1c 0d1x由reprex package(v2.0.1)于2022-05-08创建