我也遇到过类似的问题，并在SO上找到了解决方案。我认为你需要plt.ion（）。一个例子

import numpy as np
from matplotlib import pyplot as plt

def main():
    plt.axis([-20,20,0,10000])
    plt.ion()
    plt.show()

    x = np.arange(-20, 21)
    for pow in range(1,5):   # plot x^1, x^2, ..., x^4
        y = [Xi**pow for Xi in x]
        plt.plot(x, y)
        plt.draw()
        plt.pause(0.001)
        input("Press [enter] to continue.")

if __name__ == '__main__':
    main()

工作正常，但它会发出以下警告

MatplotlibDeprecationWarning: Using default event loop until function specific to this GUI is implemented
  warnings.warn(str, mplDeprecation)

我不知道这是否与3.6版本有关。