另一个使用iconv和it参数sub的解决方案：字符串。如果不是NA（这里我将其设置为''），则用于替换输入中的任何不可转换字节。

x <- "fa\xE7ile"
Encoding(x) <- "UTF-8"
iconv(x, "UTF-8", "UTF-8",sub='') ## replace any non UTF-8 by ''
"faile"

这里请注意，如果我们选择正确的编码：

x <- "fa\xE7ile"
Encoding(x) <- "latin1"
xx <- iconv(x, "latin1", "UTF-8",sub='')
facile

Yihui的xfun包有一个函数read_utf8，它试图读取一个文件，并假设它被编码为UTF-8。如果文件包含非UTF-8行，则会触发警告，让您知道哪些行包含非UTF-8字符。在后台，它使用了一个非导出函数xfun:::invalid_utf8()，简单如下：which(!is.na(x) & is.na(iconv(x, "UTF-8", "UTF-8")))。
要在字符串中检测特定的非UTF-8单词，您可以稍微修改上面的内容，并执行以下操作：

invalid_utf8_ <- function(x){

  !is.na(x) & is.na(iconv(x, "UTF-8", "UTF-8"))

}

detect_invalid_utf8 <- function(string, seperator){

  stringSplit <- unlist(strsplit(string, seperator))

  invalidIndex <- unlist(lapply(stringSplit, invalid_utf8_))

  data.frame(
    word = stringSplit[invalidIndex],
    stringIndex = which(invalidIndex == TRUE)
  )

}

x <- "This is a string fa\xE7ile blah blah blah fa\xE7ade"

detect_invalid_utf8(x, " ")

#     word stringIndex
# 1 façile    5
# 2 façade    9

另一种方法是在整个数据集上使用dspur删除坏字符：

library(dplyr)

MyDate %>%
    mutate_at(vars(MyTextVar1, MyTextVar2), function(x){gsub('[^ -~]', '', x)})

其中MyData和MyTextVar是要删除坏苹果的数据集和文本变量。这可能不如改变编码那么健壮，但通常只是删除它们就可以了。

您可以尝试使用iconv将它们转换为UTF-8字符串，而不是删除它们。

require(foreign)
dat <- read.dta("data.dta")

for (j in seq_len(ncol(dat))) {
   if (class(dat[, j]) == "factor")
       levels(dat[, j]) <- iconv(levels(dat[, j]), from = "latin1", to = "UTF-8")
}

您可以在您的情况下用更合适的编码替换latin1。由于我们无法访问您的数据，因此很难知道哪一个更合适。