您不需要关心启动脚本的创建（startScripts任务），而需要关心zip文件的创建（distZip任务），以控制文件的放置位置。为此，您可以直接使用Gradle分发插件中的distZip任务或DistributionContainer，该任务将通过Gradle应用程序插件自动应用。DistributionContainer允许您管理Gradle项目中多个发行版的创建，而Application插件默认使用main发行版。

distributions.main {
    contents {
        from startScripts
    }
}

这段代码只是将startScripts任务的输出添加到main分发内容中。它们将被放置在此发行版的根文件夹中，因为您没有使用into方法指定子CopySpec。
我假设您希望启动脚本只在根文件夹中，而不是在bin文件夹中。由于您只能根据Copy任务的源路径而不是目标路径来排除它们，因此您需要在复制它们时通过eachFile方法排除它们（因为这样它们的目标就已知了）：

distZip {
    eachFile { file ->
        if (file.path.contains('bin')) {
            file.exclude()
        }
    }
}

当然，这段代码将从zip文件中删除整个bin目录，因此您可能需要重新描述闭包中的条件以用于其他用例。

对于Gradle v8，脚本略有变化。所以，为了正确设置APP_HOME，我必须这样做：

startScripts {
    doLast {
        def windowsScriptFile = file getWindowsScript()
        def unixScriptFile = file getUnixScript()

        windowsScriptFile.text = windowsScriptFile.text.replace('set APP_HOME=%DIRNAME%..', 'set APP_HOME=%DIRNAME%')
        unixScriptFile.text = unixScriptFile.text.replace('APP_HOME=$( cd "${APP_HOME:-./}.." && pwd -P ) || exit', 'APP_HOME=$( cd "${APP_HOME:-./}" && pwd -P ) || exit')
    }
}