In [95]: import scipy

In [96]: scipy.__version__
Out[96]: '0.12.0'

In [104]: scipy.version.*version?
scipy.version.full_version
scipy.version.short_version
scipy.version.version

In [105]: scipy.version.full_version
Out[105]: '0.12.0'

In [106]: scipy.version.git_revision
Out[106]: 'cdd6b32233bbecc3e8cbc82531905b74f3ea66eb'

In [107]: scipy.version.release
Out[107]: True

In [108]: scipy.version.short_version
Out[108]: '0.12.0'

In [109]: scipy.version.version
Out[109]: '0.12.0'

请参阅SciPy documentation以供参考。

使用命令行：

python -c "import scipy; print(scipy.__version__)"

命令行中

example$:python
 >>> import scipy
 >>> scipy.__version__
 '0.9.0'

在python命令提示符下：

import scipy
print scipy.__version__

在Python 3中，你需要将它改为：

print (scipy.__version__)

使用pip list
这将给予一个包含所有已安装Python模块及其版本号的列表。
使用pip list | grep scipy过滤掉所有关于其他软件包的不必要信息。